Detalhe da pesquisa
1.
Comparing Top-Down Proteoform Identification: Deconvolution, PrSM Overlap, and PTM Detection.
J Proteome Res
; 22(7): 2199-2217, 2023 07 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37235544
2.
InDeep: 3D fully convolutional neural networks to assist in silico drug design on protein-protein interactions.
Bioinformatics
; 38(5): 1261-1268, 2022 02 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34908131
3.
The iPPI-DB initiative: a community-centered database of protein-protein interaction modulators.
Bioinformatics
; 37(1): 89-96, 2021 Apr 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33416858
4.
Phylogenetic analysis of Harmonin homology domains.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 190, 2021 Apr 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33853521
5.
Physics-Based Computational Protein Design: An Update.
J Phys Chem A
; 124(51): 10637-10648, 2020 Dec 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33170681
6.
Redesigning the stereospecificity of tyrosyl-tRNA synthetase.
Proteins
; 84(2): 240-53, 2016 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26676967
7.
Protein:Ligand binding free energies: A stringent test for computational protein design.
J Comput Chem
; 37(4): 404-15, 2016 Feb 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26503829
8.
Computational protein design: the Proteus software and selected applications.
J Comput Chem
; 34(28): 2472-84, 2013 Oct 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24037756
9.
A multiparameter optimization in middle-down analysis of monoclonal antibodies by LC-MS/MS.
J Mass Spectrom
; 58(3): e4909, 2023 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36822210
10.
Yersiniomics, a Multi-Omics Interactive Database for Yersinia Species.
Microbiol Spectr
; : e0382622, 2023 Feb 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36847572
11.
MinOmics, an Integrative and Immersive Tool for Multi-Omics Analysis.
J Integr Bioinform
; 15(2)2018 Jun 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29927748
12.
Probing the stereospecificity of tyrosyl- and glutaminyl-tRNA synthetase with molecular dynamics.
J Mol Graph Model
; 71: 192-199, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27939931
13.
A Hybrid Monte Carlo Scheme for Multibackbone Protein Design.
J Chem Theory Comput
; 12(12): 6035-6048, 2016 Dec 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27775883
14.
Proteus and the Design of Ligand Binding Sites.
Methods Mol Biol
; 1414: 77-97, 2016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27094287
15.
Sampling of conformational ensemble for virtual screening using molecular dynamics simulations and normal mode analysis.
Future Med Chem
; 7(17): 2317-31, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26599419