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J Chem Inf Model ; 54(10): 2887-901, 2014 Oct 27.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-25148533

RESUMO

The goal of this study was to design, experimentally validate, and apply a virtual screening workflow to identify novel hERG channel blockers. The hERG channel is an important antitarget in drug development since cardiotoxic risks remain as a major cause of attrition. A ligand-based pharmacophore model collection was developed and theoretically validated. The seven most complementary and suitable models were used for virtual screening of in-house and commercially available compound libraries. From the hit lists, 50 compounds were selected for experimental validation through bioactivity assessment using patch clamp techniques. Twenty compounds inhibited hERG channels expressed in HEK 293 cells with IC50 values ranging from 0.13 to 2.77 µM, attesting to the suitability of the models as cardiotoxicity prediction tools in a preclinical stage.


Assuntos
Cardiotônicos/química , Canais de Potássio Éter-A-Go-Go/química , Bloqueadores dos Canais de Potássio/química , Bibliotecas de Moléculas Pequenas/química , Sítios de Ligação , Cardiotônicos/farmacologia , Desenho de Fármacos , Avaliação Pré-Clínica de Medicamentos , Canal de Potássio ERG1 , Canais de Potássio Éter-A-Go-Go/antagonistas & inibidores , Canais de Potássio Éter-A-Go-Go/genética , Expressão Gênica , Células HEK293 , Ensaios de Triagem em Larga Escala , Humanos , Ligantes , Potenciais da Membrana/efeitos dos fármacos , Conformação Molecular , Simulação de Dinâmica Molecular , Técnicas de Patch-Clamp , Bloqueadores dos Canais de Potássio/farmacologia , Ligação Proteica , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Bibliotecas de Moléculas Pequenas/farmacologia , Relação Estrutura-Atividade , Interface Usuário-Computador
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