Detalhe da pesquisa
1.
Deep learning for computational chemistry.
J Comput Chem
; 38(16): 1291-1307, 2017 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28272810
2.
pH-dependent transient conformational states control optical properties in cyan fluorescent protein.
J Am Chem Soc
; 137(8): 2892-900, 2015 Mar 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25647152
3.
Constant pH molecular dynamics of proteins in explicit solvent with proton tautomerism.
Proteins
; 82(7): 1319-31, 2014 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24375620
4.
Uncovering pH-dependent transient states of proteins with buried ionizable residues.
J Am Chem Soc
; 136(24): 8496-9, 2014 Jun 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24842060
5.
Parameter choice matters: validating probe parameters for use in mixed-solvent simulations.
J Chem Inf Model
; 54(8): 2190-9, 2014 Aug 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25058662
6.
Characterizing the protonation state of cytosine in transient G·C Hoogsteen base pairs in duplex DNA.
J Am Chem Soc
; 135(18): 6766-9, 2013 May 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23506098
7.
The high dielectric constant of staphylococcal nuclease is encoded in its structural architecture.
J Am Chem Soc
; 133(50): 20072-5, 2011 Dec 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22085022
8.
Predicting Binding Free Energies in a Large Combinatorial Chemical Space Using Multisite λ Dynamics.
J Phys Chem Lett
; 9(12): 3328-3332, 2018 Jun 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29847134
9.
Biasing Potential Replica Exchange Multisite λ-Dynamics for Efficient Free Energy Calculations.
J Chem Theory Comput
; 11(3): 1267-77, 2015 Mar 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26579773
10.
Accurate modeling of ionic surfactants at high concentration.
J Phys Chem B
; 119(20): 6217-24, 2015 May 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25913469
11.
pH-dependent dynamics of complex RNA macromolecules.
J Chem Theory Comput
; 9(2): 935-943, 2013 Feb 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23525495
12.
Towards Accurate Prediction of Protonation Equilibrium of Nucleic Acids.
J Phys Chem Lett
; 4(5): 760-766, 2013 Mar 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23526474
13.
Constant pH Molecular Dynamics Simulations of Nucleic Acids in Explicit Solvent.
J Chem Theory Comput
; 8(1): 36-46, 2012 Jan 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22337595