Detalhe da pesquisa
1.
Scoring alignments by embedding vector similarity.
Brief Bioinform
; 25(3)2024 Mar 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38695119
2.
Quantifying Parameter Interdependence in Stochastic Discrete Models of Biochemical Systems.
Entropy (Basel)
; 25(8)2023 Aug 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37628198
3.
Hybrid stochastic simulation of reaction-diffusion systems with slow and fast dynamics.
J Chem Phys
; 143(23): 234108, 2015 Dec 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26696047
4.
SpEED: fast computation of sensitive spaced seeds.
Bioinformatics
; 27(17): 2433-4, 2011 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21690104
5.
HiTEC: accurate error correction in high-throughput sequencing data.
Bioinformatics
; 27(3): 295-302, 2011 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21115437
6.
Variable time-stepping in the pathwise numerical solution of the chemical Langevin equation.
J Chem Phys
; 137(23): 234110, 2012 Dec 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23267474
7.
An adaptive stepsize method for the chemical Langevin equation.
J Chem Phys
; 136(18): 184101, 2012 May 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22583271
8.
Seeds for effective oligonucleotide design.
BMC Genomics
; 12: 280, 2011 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21627845
9.
Fast computation of neighbor seeds.
Bioinformatics
; 25(6): 822-3, 2009 Mar 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19176560
10.
A hybrid method for micro-mesoscopic stochastic simulation of reaction-diffusion systems.
Math Biosci
; 312: 23-32, 2019 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30998936
11.
Multiple spaced seeds for homology search.
Bioinformatics
; 23(22): 2969-77, 2007 Nov 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17804438
12.
Effective implicit finite-difference method for sensitivity analysis of stiff stochastic discrete biochemical systems.
IET Syst Biol
; 12(4): 123-130, 2018 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33451187
13.
An efficient finite-difference strategy for sensitivity analysis of stochastic models of biochemical systems.
Biosystems
; 151: 43-52, 2017 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27914944
14.
Efficient computation of spaced seeds.
BMC Res Notes
; 5: 123, 2012 Feb 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22373455