Detalhe da pesquisa
1.
Improved global protein homolog detection with major gains in function identification.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(9): e2211823120, 2023 02 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36827259
2.
Characterizing interactions in E-cadherin assemblages.
Biophys J
; 122(15): 3069-3077, 2023 08 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37345249
3.
New amino acid substitution matrix brings sequence alignments into agreement with structure matches.
Proteins
; 89(6): 671-682, 2021 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33469973
4.
Opinion: Protein folds vs. protein folding: Differing questions, different challenges.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(1): e2214423119, 2023 01 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36580595
5.
Knowledge-based entropies improve the identification of native protein structures.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(11): 2928-2933, 2017 03 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28265078
6.
Directional Force Originating from ATP Hydrolysis Drives the GroEL Conformational Change.
Biophys J
; 112(8): 1561-1570, 2017 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28445748
7.
Giants among Cnidaria: Large Nuclear Genomes and Rearranged Mitochondrial Genomes in Siphonophores.
Genome Biol Evol
; 16(3)2024 Mar 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38502059
8.
Functional Protein Dynamics Directly from Sequences.
J Phys Chem B
; 127(9): 1914-1921, 2023 03 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36848294
9.
New alignment method for remote protein sequences by the direct use of pairwise sequence correlations and substitutions.
Front Bioinform
; 3: 1227193, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37900964
10.
JSONWP: a static website generator for protein bioinformatics research.
Bioinform Adv
; 3(1): vbad154, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37904893
11.
LARGE-SCALE MULTIPLE INFERENCE OF COLLECTIVE DEPENDENCE WITH APPLICATIONS TO PROTEIN FUNCTION.
Ann Appl Stat
; 15(2): 902-924, 2021 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35910493
12.
Computational Ways to Enhance Protein Inhibitor Design.
Front Mol Biosci
; 7: 607323, 2020.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33614705
13.
Ribosome Mechanics Informs about Mechanism.
J Mol Biol
; 428(5 Pt A): 802-810, 2016 Feb 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26687034
14.
The use of experimental structures to model protein dynamics.
Methods Mol Biol
; 1215: 213-36, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25330965