Detalhe da pesquisa
1.
Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment.
Proteins
; 89(12): 1800-1823, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34453465
2.
Shape-Restrained Modeling of Protein-Small-Molecule Complexes with High Ambiguity Driven DOCKing.
J Chem Inf Model
; 61(9): 4807-4818, 2021 09 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34436890
3.
An overview of data-driven HADDOCK strategies in CAPRI rounds 38-45.
Proteins
; 88(8): 1029-1036, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31886559
4.
PRODIGY-crystal: a web-tool for classification of biological interfaces in protein complexes.
Bioinformatics
; 35(22): 4821-4823, 2019 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31141126
5.
Coupling enhanced sampling of the apo-receptor with template-based ligand conformers selection: performance in pose prediction in the D3R Grand Challenge 4.
J Comput Aided Mol Des
; 34(2): 149-162, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31720895
6.
Protein-ligand pose and affinity prediction: Lessons from D3R Grand Challenge 3.
J Comput Aided Mol Des
; 33(1): 83-91, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30128928
7.
Performance of HADDOCK and a simple contact-based protein-ligand binding affinity predictor in the D3R Grand Challenge 2.
J Comput Aided Mol Des
; 32(1): 175-185, 2018 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28831657
8.
Membrane proteins structures: A review on computational modeling tools.
Biochim Biophys Acta Biomembr
; 1859(10): 2021-2039, 2017 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28716627
9.
On the application of Good-Turing statistics to quantify convergence of biomolecular simulations.
J Chem Inf Model
; 54(1): 209-17, 2014 Jan 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24358959
10.
Grcarma: A fully automated task-oriented interface for the analysis of molecular dynamics trajectories.
J Comput Chem
; 34(26): 2310-2, 2013 Oct 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24159629
11.
Martini 3 Force Field Parameters for Protein Lipidation Post-Translational Modifications.
J Chem Theory Comput
; 19(23): 8901-8918, 2023 Dec 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38019969
12.
A novel antifolate suppresses growth of FPGS-deficient cells and overcomes methotrexate resistance.
Life Sci Alliance
; 6(11)2023 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37591722
13.
Pathogen-sugar interactions revealed by universal saturation transfer analysis.
Science
; 377(6604): eabm3125, 2022 07 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35737812
14.
Structural Biology in the Clouds: The WeNMR-EOSC Ecosystem.
Front Mol Biosci
; 8: 729513, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34395534
15.
MENSAdb: a thorough structural analysis of membrane protein dimers.
Database (Oxford)
; 20212021 04 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33822911
16.
A click-flipped enzyme substrate boosts the performance of the diagnostic screening for Hunter syndrome.
Chem Sci
; 11(47): 12671-12676, 2020 Oct 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34094461
17.
Structural Characterization of Membrane Protein Dimers.
Methods Mol Biol
; 1958: 403-436, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30945231
18.
A Membrane Protein Complex Docking Benchmark.
J Mol Biol
; 430(24): 5246-5256, 2018 12 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30414967
19.
SpotOn: High Accuracy Identification of Protein-Protein Interface Hot-Spots.
Sci Rep
; 7(1): 8007, 2017 08 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28808256
20.
Folding molecular dynamics simulations accurately predict the effect of mutations on the stability and structure of a vammin-derived peptide.
J Phys Chem B
; 118(34): 10076-84, 2014 Aug 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25098230