Detalhe da pesquisa
1.
Non-Poissonian Bursts in the Arrival of Phenotypic Variation Can Strongly Affect the Dynamics of Adaptation.
Mol Biol Evol
; 41(6)2024 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38693911
2.
Bias in the arrival of variation can dominate over natural selection in Richard Dawkins's biomorphs.
PLoS Comput Biol
; 20(3): e1011893, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38536880
3.
Symmetry and simplicity spontaneously emerge from the algorithmic nature of evolution.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(11): e2113883119, 2022 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35275794
4.
Coarse-grained modeling of DNA-RNA hybrids.
J Chem Phys
; 160(11)2024 Mar 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38497475
5.
The interplay of supercoiling and thymine dimers in DNA.
Nucleic Acids Res
; 50(5): 2480-2492, 2022 03 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35188542
6.
Exploring Simplicity Bias in 1D Dynamical Systems.
Entropy (Basel)
; 26(5)2024 May 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38785675
7.
Phenotype Bias Determines How Natural RNA Structures Occupy the Morphospace of All Possible Shapes.
Mol Biol Evol
; 39(1)2022 01 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34542628
8.
Coarse-grained modelling of the structural properties of DNA origami.
Nucleic Acids Res
; 47(3): 1585-1597, 2019 02 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30605514
9.
Reply to Ocklenburg and Mundorf: The interplay of developmental bias and natural selection.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(28): e2205299119, 2022 07 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35787035
10.
Reconfigurable T-junction DNA Origami.
Angew Chem Int Ed Engl
; 59(37): 15942-15946, 2020 09 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32524699
11.
TacoxDNA: A user-friendly web server for simulations of complex DNA structures, from single strands to origami.
J Comput Chem
; 40(29): 2586-2595, 2019 11 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31301183
12.
Multi-scale coarse-graining for the study of assembly pathways in DNA-brick self-assembly.
J Chem Phys
; 148(13): 134910, 2018 Apr 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29626893
13.
Long-range correlations in the mechanics of small DNA circles under topological stress revealed by multi-scale simulation.
Nucleic Acids Res
; 44(19): 9121-9130, 2016 Nov 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27664220
14.
Genetic Correlations Greatly Increase Mutational Robustness and Can Both Reduce and Enhance Evolvability.
PLoS Comput Biol
; 12(3): e1004773, 2016 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26937652
15.
DNA hairpins destabilize duplexes primarily by promoting melting rather than by inhibiting hybridization.
Nucleic Acids Res
; 43(13): 6181-90, 2015 Jul 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26056172
16.
Modelling toehold-mediated RNA strand displacement.
Biophys J
; 108(5): 1238-47, 2015 Mar 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25762335
17.
Coarse-grained modelling of supercoiled RNA.
J Chem Phys
; 143(24): 243122, 2015 Dec 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26723607
18.
Characterizing the bending and flexibility induced by bulges in DNA duplexes.
J Chem Phys
; 142(16): 165101, 2015 Apr 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25933790
19.
Introducing improved structural properties and salt dependence into a coarse-grained model of DNA.
J Chem Phys
; 142(23): 234901, 2015 Jun 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26093573
20.
DNA hybridization kinetics: zippering, internal displacement and sequence dependence.
Nucleic Acids Res
; 41(19): 8886-95, 2013 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23935069