Detalhe da pesquisa
1.
StonPy: a tool to parse and query collections of SBGN maps in a graph database.
Bioinformatics
; 39(3)2023 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36897014
2.
Reusability and composability in process description maps: RAS-RAF-MEK-ERK signalling.
Brief Bioinform
; 22(5)2021 09 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33834185
3.
SBGN Bricks Ontology as a tool to describe recurring concepts in molecular networks.
Brief Bioinform
; 22(5)2021 09 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33758926
4.
Human-like layout algorithms for signalling hypergraphs: outlining requirements.
Brief Bioinform
; 21(1): 62-72, 2020 Jan 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30289443
5.
Newt: a comprehensive web-based tool for viewing, constructing and analyzing biological maps.
Bioinformatics
; 37(10): 1475-1477, 2021 06 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33010165
6.
COVID19 Disease Map, a computational knowledge repository of virus-host interaction mechanisms.
Mol Syst Biol
; 17(10): e10387, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34664389
7.
Community-driven roadmap for integrated disease maps.
Brief Bioinform
; 20(2): 659-670, 2019 03 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29688273
8.
cd2sbgnml: bidirectional conversion between CellDesigner and SBGN formats.
Bioinformatics
; 36(8): 2620-2622, 2020 04 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31904823
9.
Recon2Neo4j: applying graph database technologies for managing comprehensive genome-scale networks.
Bioinformatics
; 33(7): 1096-1098, 2017 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27993779
10.
COVID-19 Disease Map, a computational knowledge repository of virus-host interaction mechanisms.
Mol Syst Biol
; 17(12): e10851, 2021 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34939300
11.
AsthmaMap: An interactive knowledge repository for mechanisms of asthma.
J Allergy Clin Immunol
; 147(3): 853-856, 2021 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33309742
12.
STON: exploring biological pathways using the SBGN standard and graph databases.
BMC Bioinformatics
; 17(1): 494, 2016 Dec 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27919219
13.
cd2sbgnml: bidirectional conversion between CellDesigner and SBGN formats.
Bioinformatics
; 36(19): 4975, 2020 12 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33146381
14.
AsthmaMap: An expert-driven computational representation of disease mechanisms.
Clin Exp Allergy
; 48(8): 916-918, 2018 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30133857
15.
Severe COVID-19 versus multisystem inflammatory syndrome: comparing two critical outcomes of SARS-CoV-2 infection.
Eur Respir Rev
; 32(167)2023 Mar 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36889788
16.
Upper respiratory tract mucosal immunity for SARS-CoV-2 vaccines.
Trends Mol Med
; 29(4): 255-267, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36764906
17.
The SYSCID map: a graphical and computational resource of molecular mechanisms across rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus and inflammatory bowel disease.
Front Immunol
; 14: 1257321, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38022524
18.
A guide for developing comprehensive systems biology maps of disease mechanisms: planning, construction and maintenance.
Front Bioinform
; 3: 1197310, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37426048
19.
Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches.
Front Immunol
; 14: 1282859, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38414974
20.
GraphML-SBGN bidirectional converter for metabolic networks.
J Integr Bioinform
; 19(4)2022 Dec 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36563404