Seascape Genomics and Phylogeography of the Sailfish (Istiophorus platypterus).

Permeable phylogeographic barriers characterize the vast open ocean, boosting gene flow and counteracting population differentiation and speciation of widely distributed and migratory species. However, many widely distributed species consists of distinct populations throughout their distribution, evidencing that our understanding of how the marine environment triggers population and species divergence are insufficient. The sailfish is a circumtropical and highly migratory billfish that inhabits warm and productive areas. Despite its ecological and socioeconomic importance as a predator and fishery resource, the species is threatened by overfishing, requiring innovative approaches to improve their management and conservation status. Thus, we presented a novel high-quality reference genome for the species and applied a seascape genomics approach to understand how marine environmental features may promote local adaptation and how it affects gene flow between populations. We delimit two populations between the Atlantic and Indo-Western Pacific oceans and detect outlier loci correlated with sea surface temperature, salinity, oxygen, and chlorophyll concentrations. However, the most significant explanatory factor that explains the differences between populations was isolation by distance. Despite recent population drops, the sailfish populations are not inbred. For billfishes in general, genome-wide heterozygosity was found to be relatively low compared to other marine fishes, evidencing the need to counteract overfishing effects. In addition, in a climate change scenario, management agencies must implement state-of-the-art sequencing methods, consider our findings in their management plans, and monitor genome-wide heterozygosity over time to improve sustainable fisheries and the long-term viability of its populations.

The fishery exploitation of acoupa weakfish off São Paulo coast, Southeastern Brazil / A exploração pesqueira da pescada-amarela na costa de São Paulo, Sudeste do Brasil

The Acoupa weakfish Cynoscion acoupa (Lacepède, 1801) is a large inshore sciaenid of commercial and social importance found along the entire Brazilian coast. In spite of this, there is few information on the species, both in terms of biological aspects and fishery yields, particularly off southeastern Brazil. Within this context, this study aimed to an evaluation of Acoupa weakfish fishery production off São Paulo coast (23°22’–25°18’S) based on publicly available statistical data collected between 1998 and 2016. Acoupa weakfish fishery in this State takes place on both industrial and artisanal scales, and employs at least 22 different fishing gears. The pair-trawling fishery was the most important Acoupa weakfish producer during the period surveyed, with a sharp decline in the catches from 2007 onward due to the establishment of Marine Protected Areas off São Paulo coast, which banned trawling in depths shallower than 26 meters. Acoupa weakfish yields were relatively low in São Paulo when compared with other demersal fishes exploited, despite the high retail prices commanded by the species in regional markets and restaurants.

A pescada-amarela Cynoscion acoupa (Lacepède, 1801) é um cianídeo demersal costeiro de grande porte que apresenta importância social e econômica ao longo de toda a costa brasileira. Entretanto, há pouca informação sobre a espécie em termos biológicos e pesqueiros, principalmente no sudeste do Brasil. Dentro desse contexto, o presente estudo procurou avaliar a produção pesqueira da espécie na costa de São Paulo (23°22’–25°18’S) a partir de dados estatísticos de domínio público coletados entre 1998 e 2016. A pescaria da pescada-amarela no estado ocorre em escala industrial e artesanal, e emprega pelo menos 22 tipos de artes de pesca. O arrasto de parelhas foi o mais importante produtor durante o período estudado, apresentando um declínio abrupto nos desembarques a partir de 2007, devido a implementação de Áreas Marinhas Protegidas na costa paulista, que baniu a pesca de arrasto em profundidades menores que 26 metros. Os desembarques de pescada-amarela são relativamente baixos em comparação a outros peixes demersais capturados apesar dos altos preços de varejo cobrados para a espécie nos mercados e restaurantes regionais.

The fishery exploitation of acoupa weakfish off São Paulo coast, Southeastern Brazil / A exploração pesqueira da pescada-amarela na costa de São Paulo, Sudeste do Brasil

The Acoupa weakfish Cynoscion acoupa (Lacepède, 1801) is a large inshore sciaenid of commercial and social importance found along the entire Brazilian coast. In spite of this, there is few information on the species, both in terms of biological aspects and fishery yields, particularly off southeastern Brazil. Within this context, this study aimed to an evaluation of Acoupa weakfish fishery production off São Paulo coast (23°22–25°18S) based on publicly available statistical data collected between 1998 and 2016. Acoupa weakfish fishery in this State takes place on both industrial and artisanal scales, and employs at least 22 different fishing gears. The pair-trawling fishery was the most important Acoupa weakfish producer during the period surveyed, with a sharp decline in the catches from 2007 onward due to the establishment of Marine Protected Areas off São Paulo coast, which banned trawling in depths shallower than 26 meters. Acoupa weakfish yields were relatively low in São Paulo when compared with other demersal fishes exploited, despite the high retail prices commanded by the species in regional markets and restaurants.(AU)

A pescada-amarela Cynoscion acoupa (Lacepède, 1801) é um cianídeo demersal costeiro de grande porte que apresenta importância social e econômica ao longo de toda a costa brasileira. Entretanto, há pouca informação sobre a espécie em termos biológicos e pesqueiros, principalmente no sudeste do Brasil. Dentro desse contexto, o presente estudo procurou avaliar a produção pesqueira da espécie na costa de São Paulo (23°22–25°18S) a partir de dados estatísticos de domínio público coletados entre 1998 e 2016. A pescaria da pescada-amarela no estado ocorre em escala industrial e artesanal, e emprega pelo menos 22 tipos de artes de pesca. O arrasto de parelhas foi o mais importante produtor durante o período estudado, apresentando um declínio abrupto nos desembarques a partir de 2007, devido a implementação de Áreas Marinhas Protegidas na costa paulista, que baniu a pesca de arrasto em profundidades menores que 26 metros. Os desembarques de pescada-amarela são relativamente baixos em comparação a outros peixes demersais capturados apesar dos altos preços de varejo cobrados para a espécie nos mercados e restaurantes regionais.(AU)

Catch composition in the fishery for tunas and tuna-likes on aggregated schools in the Western Equatorial Atlantic / Composição das capturas na pesca de atuns e afins em cardumes associados no Atlântico Oeste Equatorial

The present study aims to characterize the catch composition of the fishery for tunas in associated schools in the western equatorial Atlantic. For this purpose, a total of 109 landings on Areia Branca-RN, were observed, from June 2010 to May 2013, as well as on board in nine fishing cruises, from February 2011 to December 2012. The monitored fleet consisted of 9 boats, with an average length overall of 13.4 m. Landings amounted 691,533 kg (6,344.3 ± 292.7 kg), with a predominance of bigeye and yellowfin tunas, and other bycatch species, such as dolphinfish, blue marlin, skipjack tuna, wahoo, and rainbow runner. Occasionally, other species such as swordfish and triggerfish were also observed.

O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a composição das capturas na pesca de atuns e afins em cardumes associados no Atlântico Oeste Equatorial, realizadas por parte da frota sediada no Município de Areia Branca, RN. Para tanto foram acompanhados 109 desembarques nos cais pesqueiros da cidade, oriundos de nove embarcações com comprimento total médio de 13,4 m, no período entre junho de 2010 e maio de 2013. Além disso, também foram realizados nove embarques no período de fevereiro de 2011 a dezembro de 2012, durante os quais foi realizada a biometria das principais espécies capturadas. Os desembarques totalizaram 691.533 kg (6.344,3 kg em média ± desvio padrão de 292,7 kg) de pescado, com predominância de albacora-bandolim e albacora-laje, além de outras espécies como o dourado, agulhão-negro, bonito-listrado, cavala-empinge, peixe-rei e ocorrências esporádicas de outros peixes, como o espadarte e o cangulo.

Catch composition in the fishery for tunas and tuna-likes on aggregated schools in the Western Equatorial Atlantic / Composição das capturas na pesca de atuns e afins em cardumes associados no Atlântico Oeste Equatorial

The present study aims to characterize the catch composition of the fishery for tunas in associated schools in the western equatorial Atlantic. For this purpose, a total of 109 landings on Areia Branca-RN, were observed, from June 2010 to May 2013, as well as on board in nine fishing cruises, from February 2011 to December 2012. The monitored fleet consisted of 9 boats, with an average length overall of 13.4 m. Landings amounted 691,533 kg (6,344.3 ± 292.7 kg), with a predominance of bigeye and yellowfin tunas, and other bycatch species, such as dolphinfish, blue marlin, skipjack tuna, wahoo, and rainbow runner. Occasionally, other species such as swordfish and triggerfish were also observed.(AU)

O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a composição das capturas na pesca de atuns e afins em cardumes associados no Atlântico Oeste Equatorial, realizadas por parte da frota sediada no Município de Areia Branca, RN. Para tanto foram acompanhados 109 desembarques nos cais pesqueiros da cidade, oriundos de nove embarcações com comprimento total médio de 13,4 m, no período entre junho de 2010 e maio de 2013. Além disso, também foram realizados nove embarques no período de fevereiro de 2011 a dezembro de 2012, durante os quais foi realizada a biometria das principais espécies capturadas. Os desembarques totalizaram 691.533 kg (6.344,3 kg em média ± desvio padrão de 292,7 kg) de pescado, com predominância de albacora-bandolim e albacora-laje, além de outras espécies como o dourado, agulhão-negro, bonito-listrado, cavala-empinge, peixe-rei e ocorrências esporádicas de outros peixes, como o espadarte e o cangulo.(AU)

Distribuição do agulhão negro no atlântico sul e equatorial e potencial de estratégia de manejo espacial / Distribution of the blue marlin in the South Atlantic and Equatorial and potential spatial strategy management

This study aimed to test simulations of fisheries closures for Makaira nigricans. Generalized Additive Models were used, with fishing data and environmental variables to determine the interference of these factors in the Catch Per Unit Effort (CPUE) of blue marlin. The final model explained 40% of variability in CPUE, with higher records up to 50 m deep and temperatures between 27 C and 29 C. The annual spatial prediction demonstrated the existence of an area with more expressive CPUE in the central portion of the South Atlantic. It was also observed a spatial heterogeneity in the CPUE of blue marlin during the months of the year, with a clear seasonal variation mainly on 1st and 4th quarter. Therefore, two areas were chosen for the fishing zone simulations (A1: 15º-20ºS/25º-30ºW and A2: 20-25S/30º-35ºW). Reducing blue marlin catches not affected in the same proportion the catches of the target species (swordfish).(AU)

O presente trabalho teve como objetivo testar simulações de fechamentos de áreas de pesca para Makaira nigricans. Foram utilizados os Modelos Aditivos Generalizados, com dados de pesca e de variáveis ambientais para determinar a interferência destes fatores na Captura por Unidade de Esforço (CPUE) do agulhão negro. O modelo final explicou 40% da variabilidade da CPUE, com maiores registros até 50 m de profundidade e temperatura entre 27 C e 29 C. A predição espacial anual demonstrou haver uma área com CPUE mais expressiva na porção central do Atlântico Sul. Constatou-se também uma heterogeneidade espacial na CPUE do agulhão negro durante os meses do ano, com uma variação sazonal bem definida, principalmente no 1 e 4º trimestre. Portanto, duas áreas foram escolhidas para as simulações de fechamentos (A1: 15º-20ºS/25º-30ºW e A2: 20-25S/30º-35ºW). A redução das capturas de agulhão negro não afetou, na mesma proporção, as capturas da espécie alvo (espadarte).(AU)

Distribuição do agulhão negro no atlântico sul e equatorial e potencial de estratégia de manejo espacial / Distribution of the blue marlin in the South Atlantic and Equatorial and potential spatial strategy management

This study aimed to test simulations of fisheries closures for Makaira nigricans. Generalized Additive Models were used, with fishing data and environmental variables to determine the interference of these factors in the Catch Per Unit Effort (CPUE) of blue marlin. The final model explained 40% of variability in CPUE, with higher records up to 50 m deep and temperatures between 27 C and 29 C. The annual spatial prediction demonstrated the existence of an area with more expressive CPUE in the central portion of the South Atlantic. It was also observed a spatial heterogeneity in the CPUE of blue marlin during the months of the year, with a clear seasonal variation mainly on 1st and 4th quarter. Therefore, two areas were chosen for the fishing zone simulations (A1: 15º-20ºS/25º-30ºW and A2: 20-25S/30º-35ºW). Reducing blue marlin catches not affected in the same proportion the catches of the target species (swordfish).

O presente trabalho teve como objetivo testar simulações de fechamentos de áreas de pesca para Makaira nigricans. Foram utilizados os Modelos Aditivos Generalizados, com dados de pesca e de variáveis ambientais para determinar a interferência destes fatores na Captura por Unidade de Esforço (CPUE) do agulhão negro. O modelo final explicou 40% da variabilidade da CPUE, com maiores registros até 50 m de profundidade e temperatura entre 27 C e 29 C. A predição espacial anual demonstrou haver uma área com CPUE mais expressiva na porção central do Atlântico Sul. Constatou-se também uma heterogeneidade espacial na CPUE do agulhão negro durante os meses do ano, com uma variação sazonal bem definida, principalmente no 1 e 4º trimestre. Portanto, duas áreas foram escolhidas para as simulações de fechamentos (A1: 15º-20ºS/25º-30ºW e A2: 20-25S/30º-35ºW). A redução das capturas de agulhão negro não afetou, na mesma proporção, as capturas da espécie alvo (espadarte).