Pesquisa | Biblioteca Virtual em Saúde

1.

Systematic computational prediction of protein interaction networks.

Lees, J G; Heriche, J K; Morilla, I; Ranea, J A; Orengo, C A.

Phys Biol ; 8(3): 035008, 2011 Jun.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21572181

2.

FFPred: an integrated feature-based function prediction server for vertebrate proteomes.

Lobley, A E; Nugent, T; Orengo, C A; Jones, D T.

Nucleic Acids Res ; 36(Web Server issue): W297-302, 2008 Jul 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-18463141

3.

SARS-CoV-2 spike protein predicted to form complexes with host receptor protein orthologues from a broad range of mammals.

Lam, S D; Bordin, N; Waman, V P; Scholes, H M; Ashford, P; Sen, N; van Dorp, L; Rauer, C; Dawson, N L; Pang, C S M; Abbasian, M; Sillitoe, I; Edwards, S J L; Fraternali, F; Lees, J G; Santini, J M; Orengo, C A.

Sci Rep ; 10(1): 16471, 2020 10 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33020502

4.

Recurring structural motifs in proteins with different functions.

Orengo, C A; Flores, T P; Jones, D T; Taylor, W R; Thornton, J M.

Curr Biol ; 3(3): 131-9, 1993 Mar.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-15335780

5.

From protein structure to function.

Orengo, C A; Todd, A E; Thornton, J M.

Curr Opin Struct Biol ; 9(3): 374-82, 1999 Jun.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-10361094

6.

VIDA: a virus database system for the organization of animal virus genome open reading frames.

Albà, M M; Lee, D; Pearl, F M; Shepherd, A J; Martin, N; Orengo, C A; Kellam, P.

Nucleic Acids Res ; 29(1): 133-6, 2001 Jan 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-11125070

7.

The CATH database: an extended protein family resource for structural and functional genomics.

Pearl, F M G; Bennett, C F; Bray, J E; Harrison, A P; Martin, N; Shepherd, A; Sillitoe, I; Thornton, J; Orengo, C A.

Nucleic Acids Res ; 31(1): 452-5, 2003 Jan 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-12520050

8.

A rapid classification protocol for the CATH Domain Database to support structural genomics.

Pearl, F M; Martin, N; Bray, J E; Buchan, D W; Harrison, A P; Lee, D; Reeves, G A; Shepherd, A J; Sillitoe, I; Todd, A E; Thornton, J M; Orengo, C A.

Nucleic Acids Res ; 29(1): 223-7, 2001 Jan 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-11125098

9.

Alpha plus beta folds revisited: some favoured motifs.

Orengo, C A; Thornton, J M.

Structure ; 1(2): 105-20, 1993 Oct 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-8069624

10.

CATH--a hierarchic classification of protein domain structures.

Orengo, C A; Michie, A D; Jones, S; Jones, D T; Swindells, M B; Thornton, J M.

Structure ; 5(8): 1093-108, 1997 Aug 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-9309224

11.

Protein folds and functions.

Martin, A C; Orengo, C A; Hutchinson, E G; Jones, S; Karmirantzou, M; Laskowski, R A; Mitchell, J B; Taroni, C; Thornton, J M.

Structure ; 6(7): 875-84, 1998 Jul 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-9687369

12.

Evolution of protein function, from a structural perspective.

Todd, A E; Orengo, C A; Thornton, J M.

Curr Opin Chem Biol ; 3(5): 548-56, 1999 Oct.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-10508675

13.

A local alignment method for protein structure motifs.

Orengo, C A; Taylor, W R.

J Mol Biol ; 233(3): 488-97, 1993 Oct 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-8411157

14.

Protein structure alignment.

Taylor, W R; Orengo, C A.

J Mol Biol ; 208(1): 1-22, 1989 Jul 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-2769748

15.

Analysis of domain structural class using an automated class assignment protocol.

Michie, A D; Orengo, C A; Thornton, J M.

J Mol Biol ; 262(2): 168-85, 1996 Sep 20.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-8831787

16.

Evolution of function in protein superfamilies, from a structural perspective.

Todd, A E; Orengo, C A; Thornton, J M.

J Mol Biol ; 307(4): 1113-43, 2001 Apr 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-11286560

17.

Correlation of observed fold frequency with the occurrence of local structural motifs.

Salem, G M; Hutchinson, E G; Orengo, C A; Thornton, J M.

J Mol Biol ; 287(5): 969-81, 1999 Apr 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-10222204

18.

Protein folds, functions and evolution.

Thornton, J M; Orengo, C A; Todd, A E; Pearl, F M.

J Mol Biol ; 293(2): 333-42, 1999 Oct 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-10529349

19.

CORA--topological fingerprints for protein structural families.

Orengo, C A.

Protein Sci ; 8(4): 699-715, 1999 Apr.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-10211816

20.

Multiple protein structure alignment.

Taylor, W R; Flores, T P; Orengo, C A.

Protein Sci ; 3(10): 1858-70, 1994 Oct.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-7849601

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