Detalhe da pesquisa
1.
Mass Spectrometry-Based Pipeline for Identifying RNA Modifications Involved in a Functional Process: Application to Cancer Cell Adaptation.
Anal Chem
; 96(5): 1825-1833, 2024 02 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38275837
2.
dipwmsearch: a Python package for searching di-PWM motifs.
Bioinformatics
; 39(4)2023 04 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37010504
3.
EPIK: precise and scalable evolutionary placement with informative k-mers.
Bioinformatics
; 39(12)2023 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37975872
4.
Physical modeling of ribosomes along messenger RNA: Estimating kinetic parameters from ribosome profiling experiments using a ballistic model.
PLoS Comput Biol
; 19(10): e1011522, 2023 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37862386
5.
FT-GPI, a highly sensitive and accurate predictor of GPI-anchored proteins, reveals the composition and evolution of the GPI proteome in Plasmodium species.
Malar J
; 22(1): 27, 2023 Jan 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36698187
6.
PEWO: a collection of workflows to benchmark phylogenetic placement.
Bioinformatics
; 36(21): 5264-5266, 2021 01 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32697844
7.
Rapid screening and detection of inter-type viral recombinants using phylo-k-mers.
Bioinformatics
; 36(22-23): 5351-5360, 2021 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33331849
8.
The multifaceted functions of the Fat mass and Obesity-associated protein (FTO) in normal and cancer cells.
RNA Biol
; 19(1): 132-142, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35067178
9.
De novo assembly of viral quasispecies using overlap graphs.
Genome Res
; 27(5): 835-848, 2017 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28396522
10.
AQUAPONY: visualization and interpretation of phylogeographic information on phylogenetic trees.
Bioinformatics
; 35(17): 3163-3165, 2019 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30649190
11.
Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs.
Bioinformatics
; 33(6): 799-806, 2017 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27273673
12.
Functional analysis of Plasmodium falciparum subpopulations associated with artemisinin resistance in Cambodia.
Malar J
; 16(1): 493, 2017 Dec 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29258508
13.
Read mapping on de Bruijn graphs.
BMC Bioinformatics
; 17(1): 237, 2016 Jun 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27306641
14.
Combining DGE and RNA-sequencing data to identify new polyA+ non-coding transcripts in the human genome.
Nucleic Acids Res
; 42(5): 2820-32, 2014 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24357408
15.
YOC, A new strategy for pairwise alignment of collinear genomes.
BMC Bioinformatics
; 16: 111, 2015 Apr 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25885358
16.
LoRDEC: accurate and efficient long read error correction.
Bioinformatics
; 30(24): 3506-14, 2014 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25165095
17.
An improved genome of the model marine alga Ostreococcus tauri unfolds by assessing Illumina de novo assemblies.
BMC Genomics
; 15: 1103, 2014 Dec 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25494611
18.
Genome-scale analysis of metazoan replication origins reveals their organization in specific but flexible sites defined by conserved features.
Genome Res
; 21(9): 1438-49, 2011 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21750104
19.
An alternative approach to multiple genome comparison.
Nucleic Acids Res
; 39(15): e101, 2011 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21646341
20.
Computing Phylo- k-Mers.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 20(5): 2889-2897, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37204943