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Nat Commun ; 12(1): 6115, 2021 10 21.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34675193

RESUMO

Genome-wide association studies (GWAS) have implicated the IL33 locus in asthma, but the underlying mechanisms remain unclear. Here, we identify a 5 kb region within the GWAS-defined segment that acts as an enhancer-blocking element in vivo and in vitro. Chromatin conformation capture showed that this 5 kb region loops to the IL33 promoter, potentially regulating its expression. We show that the asthma-associated single nucleotide polymorphism (SNP) rs1888909, located within the 5 kb region, is associated with IL33 gene expression in human airway epithelial cells and IL-33 protein expression in human plasma, potentially through differential binding of OCT-1 (POU2F1) to the asthma-risk allele. Our data demonstrate that asthma-associated variants at the IL33 locus mediate allele-specific regulatory activity and IL33 expression, providing a mechanism through which a regulatory SNP contributes to genetic risk of asthma.


Assuntos
Asma/genética , Elementos Facilitadores Genéticos , Interleucina-33/genética , Alelos , Animais , Asma/metabolismo , Cromatina/genética , Cromatina/metabolismo , Feminino , Predisposição Genética para Doença , Humanos , Interleucina-33/metabolismo , Masculino , Camundongos Transgênicos , Fator 1 de Transcrição de Octâmero/genética , Fator 1 de Transcrição de Octâmero/metabolismo , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Regiões Promotoras Genéticas , Peixe-Zebra
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