Detalhe da pesquisa
1.
Mimicking non-ideal instrument behavior for hologram processing using neural style translation.
Opt Express
; 31(12): 20049-20067, 2023 Jun 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37381407
2.
Generative and interpretable machine learning for aptamer design and analysis of in vitro sequence selection.
PLoS Comput Biol
; 18(9): e1010561, 2022 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36174101
3.
Understanding DNA interactions in crowded environments with a coarse-grained model.
Nucleic Acids Res
; 48(19): 10726-10738, 2020 11 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33045749
4.
Coarse-grained modelling of the structural properties of DNA origami.
Nucleic Acids Res
; 47(3): 1585-1597, 2019 02 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30605514
5.
DNA bipedal motor walking dynamics: an experimental and theoretical study of the dependency on step size.
Nucleic Acids Res
; 46(3): 1553-1561, 2018 02 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29294083
6.
Multi-scale coarse-graining for the study of assembly pathways in DNA-brick self-assembly.
J Chem Phys
; 148(13): 134910, 2018 Apr 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29626893
7.
DNA hairpins destabilize duplexes primarily by promoting melting rather than by inhibiting hybridization.
Nucleic Acids Res
; 43(13): 6181-90, 2015 Jul 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26056172
8.
Characterizing the bending and flexibility induced by bulges in DNA duplexes.
J Chem Phys
; 142(16): 165101, 2015 Apr 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25933790
9.
Introducing improved structural properties and salt dependence into a coarse-grained model of DNA.
J Chem Phys
; 142(23): 234901, 2015 Jun 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26093573
10.
Coarse-graining DNA for simulations of DNA nanotechnology.
Phys Chem Chem Phys
; 15(47): 20395-414, 2013 Dec 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24121860
11.
Statistical mechanical treatments of protein amyloid formation.
Int J Mol Sci
; 14(9): 17420-52, 2013 Aug 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23979423
12.
The oxDNA Coarse-Grained Model as a Tool to Simulate DNA Origami.
Methods Mol Biol
; 2639: 93-112, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37166713
13.
Characterizing the free-energy landscapes of DNA origamis.
Nanoscale
; 14(7): 2638-2648, 2022 Feb 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35129570
14.
Automated design of 3D DNA origami with non-rasterized 2D curvature.
Sci Adv
; 8(51): eade4455, 2022 Dec 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36563147
15.
A statistical mechanical approach to protein aggregation.
J Chem Phys
; 135(23): 235102, 2011 Dec 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22191902
16.
Stochastic Kinetic Treatment of Protein Aggregation and the Effects of Macromolecular Crowding.
J Phys Chem B
; 125(23): 6068-6079, 2021 06 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34080429
17.
Investigating the Effects of Molecular Crowding on the Kinetics of Protein Aggregation.
J Phys Chem B
; 124(44): 9829-9839, 2020 11 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33104345
18.
Learning Retrosynthetic Planning through Simulated Experience.
ACS Cent Sci
; 5(6): 970-981, 2019 Jun 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31263756
19.
Self-assembly of two-dimensional binary quasicrystals: a possible route to a DNA quasicrystal.
J Phys Condens Matter
; 29(1): 014006, 2017 Jan 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27830657
20.
Characterizing the Motion of Jointed DNA Nanostructures Using a Coarse-Grained Model.
ACS Nano
; 11(12): 12426-12435, 2017 12 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29083876