Detalhe da pesquisa
1.
Compositionally Constrained Sites Drive Long-Branch Attraction.
Syst Biol
; 72(4): 767-780, 2023 08 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36946562
2.
Recoding Amino Acids to a Reduced Alphabet may Increase or Decrease Phylogenetic Accuracy.
Syst Biol
; 72(3): 723-737, 2023 Jun 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35713492
3.
Relative Time Constraints Improve Molecular Dating.
Syst Biol
; 71(4): 797-809, 2022 06 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34668564
4.
Distinguishing excess mutations and increased cell death based on variant allele frequencies.
PLoS Comput Biol
; 18(4): e1010048, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35468135
5.
Scalable Empirical Mixture Models That Account for Across-Site Compositional Heterogeneity.
Mol Biol Evol
; 37(12): 3616-3631, 2020 12 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32877529
6.
IQ-TREE 2: New Models and Efficient Methods for Phylogenetic Inference in the Genomic Era.
Mol Biol Evol
; 37(5): 1530-1534, 2020 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32011700
7.
Polymorphism-Aware Species Trees with Advanced Mutation Models, Bootstrap, and Rate Heterogeneity.
Mol Biol Evol
; 36(6): 1294-1301, 2019 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30825307
8.
Inference in population genetics using forward and backward, discrete and continuous time processes.
J Theor Biol
; 439: 166-180, 2018 02 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29229523
9.
An alternative derivation of the stationary distribution of the multivariate neutral Wright-Fisher model for low mutation rates with a view to mutation rate estimation from site frequency data.
Theor Popul Biol
; 114: 88-94, 2017 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28041892
10.
Corrigendum to: IQ-TREE 2: New Models and Efficient Methods for Phylogenetic Inference in the Genomic Era.
Mol Biol Evol
; 37(8): 2461, 2020 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32556291
11.
PoMo: An Allele Frequency-Based Approach for Species Tree Estimation.
Syst Biol
; 64(6): 1018-31, 2015 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26209413
12.
Reversible polymorphism-aware phylogenetic models and their application to tree inference.
J Theor Biol
; 407: 362-370, 2016 10 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27480613
13.
ATP synthase evolution on a cross-braced dated tree of life.
Nat Commun
; 14(1): 7456, 2023 11 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37978174
14.
Relative Time Inference Using Lateral Gene Transfers.
Methods Mol Biol
; 2569: 75-94, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36083444
15.
Divergent evolutionary trajectories of bryophytes and tracheophytes from a complex common ancestor of land plants.
Nat Ecol Evol
; 6(11): 1634-1643, 2022 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36175544
16.
Inferring the Deep Past from Molecular Data.
Genome Biol Evol
; 13(5)2021 05 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33772552
17.
The comparative genomics and complex population history of Papio baboons.
Sci Adv
; 5(1): eaau6947, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30854422