Detalhe da pesquisa
1.
A Multipathway Phosphopeptide Standard for Rapid Phosphoproteomics Assay Development.
Mol Cell Proteomics
; 22(10): 100639, 2023 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37657519
2.
Computational approaches to identify sites of phosphorylation.
Proteomics
; 24(8): e2300088, 2024 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37897210
3.
Gas-Phase Fractionation Data-Independent Acquisition Analysis of 3D Cocultured Spheroid Tumor Model Reveals Altered Translational Processes and Signaling Using Proteomics.
J Proteome Res
; 2024 Feb 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38412258
4.
A differential proteomics study of cerebrospinal fluid from individuals with Niemann-Pick disease, Type C1.
Proteomics
; 23(11): e2200378, 2023 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36638187
5.
Scribe: Next Generation Library Searching for DDA Experiments.
J Proteome Res
; 22(2): 482-490, 2023 02 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36695531
6.
nf-encyclopedia: A Cloud-Ready Pipeline for Chromatogram Library Data-Independent Acquisition Proteomics Workflows.
J Proteome Res
; 22(8): 2743-2749, 2023 08 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37417926
7.
Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition.
J Proteome Res
; 22(10): 3290-3300, 2023 10 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37683181
8.
Optimizing Linear Ion-Trap Data-Independent Acquisition toward Single-Cell Proteomics.
Anal Chem
; 95(26): 9881-9891, 2023 07 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37338819
9.
High Sensitivity Limited Material Proteomics Empowered by Data-Independent Acquisition on Linear Ion Traps.
J Proteome Res
; 21(11): 2815-2826, 2022 11 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36287219
10.
Data-Independent Acquisition Protease-Multiplexing Enables Increased Proteome Sequence Coverage Across Multiple Fragmentation Modes.
J Proteome Res
; 21(4): 1124-1136, 2022 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35234472
11.
Thesaurus: quantifying phosphopeptide positional isomers.
Nat Methods
; 16(8): 703-706, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31363206
12.
Acquiring and Analyzing Data Independent Acquisition Proteomics Experiments without Spectrum Libraries.
Mol Cell Proteomics
; 19(7): 1088-1103, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32312845
13.
Assessing Protein Sequence Database Suitability Using De Novo Sequencing.
Mol Cell Proteomics
; 19(1): 198-208, 2020 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31732549
14.
CIDer: A Statistical Framework for Interpreting Differences in CID and HCD Fragmentation.
J Proteome Res
; 20(4): 1951-1965, 2021 04 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33729787
15.
The Skyline ecosystem: Informatics for quantitative mass spectrometry proteomics.
Mass Spectrom Rev
; 39(3): 229-244, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28691345
16.
Matrix-Matched Calibration Curves for Assessing Analytical Figures of Merit in Quantitative Proteomics.
J Proteome Res
; 19(3): 1147-1153, 2020 03 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32037841
17.
Lysine and Arginine Protein Post-translational Modifications by Enhanced DIA Libraries: Quantification in Murine Liver Disease.
J Proteome Res
; 19(10): 4163-4178, 2020 10 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32966080
18.
Urine Proteomics Profiling Identifies Novel Acute Pancreatitis Diagnostic Biomarkers in a Pediatric Population.
Gastroenterology
; 2024 May 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38797238
19.
PECAN: library-free peptide detection for data-independent acquisition tandem mass spectrometry data.
Nat Methods
; 14(9): 903-908, 2017 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28783153
20.
Incorporating In-Source Fragment Information Improves Metabolite Identification Accuracy in Untargeted LC-MS Data Sets.
J Proteome Res
; 18(2): 791-796, 2019 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30295490