Detalhe da pesquisa
1.
Large-scale benchmarking of circRNA detection tools reveals large differences in sensitivity but not in precision.
Nat Methods
; 20(8): 1159-1169, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37443337
2.
Led-Seq: ligation-enhanced double-end sequence-based structure analysis of RNA.
Nucleic Acids Res
; 51(11): e63, 2023 06 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37114986
3.
The expansion of chemical space in 1826 and in the 1840s prompted the convergence to the periodic system.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(30): e2119083119, 2022 Jul 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35867818
4.
A guide to naming human non-coding RNA genes.
EMBO J
; 39(6): e103777, 2020 03 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32090359
5.
Synthetic riboswitches for the analysis of tRNA processing by eukaryotic RNase P enzymes.
RNA
; 28(4): 551-567, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35022261
6.
BioAutoML: automated feature engineering and metalearning to predict noncoding RNAs in bacteria.
Brief Bioinform
; 23(4)2022 07 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35753697
7.
RNA interaction format: a general data format for RNA interactions.
Bioinformatics
; 39(11)2023 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37944046
8.
Virus Evolution on Fitness Landscapes.
Curr Top Microbiol Immunol
; 439: 1-94, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36592242
9.
BioDeepfuse: a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification.
RNA Biol
; 21(1): 1-12, 2024 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38528797
10.
Detecting gene breakpoints in noisy genome sequences using position-annotated colored de-Bruijn graphs.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 235, 2023 Jun 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37277700
11.
Mitochondrial Genomes in Perkinsus Decode Conserved Frameshifts in All Genes.
Mol Biol Evol
; 39(10)2022 10 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36108082
12.
Comprehensive benchmarking of software for mapping whole genome bisulfite data: from read alignment to DNA methylation analysis.
Brief Bioinform
; 22(5)2021 09 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33624017
13.
Functional ecology of planktonic ciliates: Measuring mortality rates in response to starvation.
J Eukaryot Microbiol
; 70(4): e12969, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36825816
14.
Ligand-dependent tRNA processing by a rationally designed RNase P riboswitch.
Nucleic Acids Res
; 49(3): 1784-1800, 2021 02 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33469651
15.
Human pathways in animal models: possibilities and limitations.
Nucleic Acids Res
; 49(4): 1859-1871, 2021 02 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33524155
16.
HumanMetagenomeDB: a public repository of curated and standardized metadata for human metagenomes.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D743-D750, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33221926
17.
Multiomics reveal unique signatures of human epiploic adipose tissue related to systemic insulin resistance.
Gut
; 71(11): 2179-2193, 2022 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34598978
18.
PTEN regulates adipose progenitor cell growth, differentiation, and replicative aging.
J Biol Chem
; 297(2): 100968, 2021 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34273354
19.
Manipulating base quality scores enables variant calling from bisulfite sequencing alignments using conventional bayesian approaches.
BMC Genomics
; 23(1): 477, 2022 Jun 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35764934
20.
Evolution of DNA Methylation Across Ecdysozoa.
J Mol Evol
; 90(1): 56-72, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35089376