Detalhe da pesquisa
1.
Tempo and Mode of Genome Evolution in the Budding Yeast Subphylum.
Cell
; 175(6): 1533-1545.e20, 2018 11 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30415838
2.
Incongruence in the phylogenomics era.
Nat Rev Genet
; 24(12): 834-850, 2023 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37369847
3.
The promise and pitfalls of synteny in phylogenomics.
PLoS Biol
; 22(5): e3002632, 2024 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38768403
4.
CryptoCEN: A Co-Expression Network for Cryptococcus neoformans reveals novel proteins involved in DNA damage repair.
PLoS Genet
; 20(2): e1011158, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38359090
5.
The dawn of relaxed phylogenetics.
PLoS Biol
; 21(1): e3001998, 2023 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36696649
6.
A global phylogenomic analysis of the shiitake genus Lentinula.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(10): e2214076120, 2023 03 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36848567
7.
OrthoSNAP: A tree splitting and pruning algorithm for retrieving single-copy orthologs from gene family trees.
PLoS Biol
; 20(10): e3001827, 2022 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36228036
8.
Regulation of gliotoxin biosynthesis and protection in Aspergillus species.
PLoS Genet
; 18(1): e1009965, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35041649
9.
Genomic, transcriptomic, and ecological diversity of Penicillium species in cheese rind microbiomes.
Fungal Genet Biol
; 171: 103862, 2024 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38218228
10.
Natural trait variation across Saccharomycotina species.
FEMS Yeast Res
; 242024 01 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38218591
11.
Signatures of optimal codon usage in metabolic genes inform budding yeast ecology.
PLoS Biol
; 19(4): e3001185, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33872297
12.
Correction: Variation and selection on codon usage bias across an entire subphylum.
PLoS Genet
; 17(9): e1009824, 2021 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34570754
13.
ClipKIT: A multiple sequence alignment trimming software for accurate phylogenomic inference.
PLoS Biol
; 18(12): e3001007, 2020 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33264284
14.
PhyKIT: a broadly applicable UNIX shell toolkit for processing and analyzing phylogenomic data.
Bioinformatics
; 37(16): 2325-2331, 2021 Aug 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33560364
15.
The Aspergillus fumigatus transcription factor RglT is important for gliotoxin biosynthesis and self-protection, and virulence.
PLoS Pathog
; 16(7): e1008645, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32667960
16.
Dissecting Incongruence between Concatenation- and Quartet-Based Approaches in Phylogenomic Data.
Syst Biol
; 70(5): 997-1014, 2021 08 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33616672
17.
Extensive loss of cell-cycle and DNA repair genes in an ancient lineage of bipolar budding yeasts.
PLoS Biol
; 17(5): e3000255, 2019 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31112549
18.
Variation and selection on codon usage bias across an entire subphylum.
PLoS Genet
; 15(7): e1008304, 2019 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31365533
19.
Biosynthetic gene clusters and the evolution of fungal chemodiversity.
Nat Prod Rep
; 37(7): 868-878, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31898704
20.
Know the enemy and know yourself: Addressing cryptic fungal pathogens of humans and beyond.
PLoS Pathog
; 19(10): e1011704, 2023 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37856485