Detalhe da pesquisa
1.
kb_DRAM: annotation and metabolic profiling of genomes with DRAM in KBase.
Bioinformatics
; 39(4)2023 04 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36857575
2.
Planet Microbe: a platform for marine microbiology to discover and analyze interconnected 'omics and environmental data.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D792-D802, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32735679
3.
The ModelSEED Biochemistry Database for the integration of metabolic annotations and the reconstruction, comparison and analysis of metabolic models for plants, fungi and microbes.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D575-D588, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32986834
4.
Diel cycling and long-term persistence of viruses in the ocean's euphotic zone.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(43): 11446-11451, 2017 10 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29073070
5.
Reef invertebrate viromics: diversity, host specificity and functional capacity.
Environ Microbiol
; 20(6): 2125-2141, 2018 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29575552
6.
Ten simple rules for getting and giving credit for data.
PLoS Comput Biol
; 18(9): e1010476, 2022 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36173960
7.
The ModelSEED Biochemistry Database for the integration of metabolic annotations and the reconstruction, comparison and analysis of metabolic models for plants, fungi and microbes.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D1555, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33179751
8.
Metagenomic characterization of viral communities in corals: mining biological signal from methodological noise.
Environ Microbiol
; 17(10): 3440-9, 2015 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25708646
9.
The Importance of Sharing Data in Systems Biology.
Metabolites
; 13(1)2023 Jan 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36677023
10.
Metagenome-assembled genome extraction and analysis from microbiomes using KBase.
Nat Protoc
; 18(1): 208-238, 2023 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36376589
11.
A functional microbiome catalog crowdsourced from North American rivers.
bioRxiv
; 2023 Jul 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37502915
12.
Ontology-Enriched Specifications Enabling Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable Marine Metagenomic Datasets in Cyberinfrastructure Systems.
Front Microbiol
; 12: 765268, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34956127
13.
iVirus 2.0: Cyberinfrastructure-supported tools and data to power DNA virus ecology.
ISME Commun
; 1(1): 77, 2021 Dec 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36765102
14.
A genomic catalog of Earth's microbiomes.
Nat Biotechnol
; 39(4): 499-509, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33169036
15.
Microbiome Metadata Standards: Report of the National Microbiome Data Collaborative's Workshop and Follow-On Activities.
mSystems
; 6(1)2021 02 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33622857
16.
Thermal stress modifies the marine sponge virome.
Environ Microbiol Rep
; 11(5): 690-698, 2019 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31283094
17.
iMicrobe: Tools and data-dreaiven discovery platform for the microbiome sciences.
Gigascience
; 8(7)2019 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31289831
18.
Publisher Correction: Metagenome-assembled genome extraction and analysis from microbiomes using KBase.
Nat Protoc
; 18(2): 658, 2023 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36451056
19.
Cohort-based learning for microbiome research community standards.
Nat Microbiol
; 8(5): 751-753, 2023 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37069400
20.
Coral-associated viral communities show high levels of diversity and host auxiliary functions.
PeerJ
; 5: e4054, 2017.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29158985