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1.

A cryptic plasmid is among the most numerous genetic elements in the human gut.

Fogarty, Emily C; Schechter, Matthew S; Lolans, Karen; Sheahan, Madeline L; Veseli, Iva; Moore, Ryan M; Kiefl, Evan; Moody, Thomas; Rice, Phoebe A; Yu, Michael K; Mimee, Mark; Chang, Eugene B; Ruscheweyh, Hans-Joachim; Sunagawa, Shinichi; Mclellan, Sandra L; Willis, Amy D; Comstock, Laurie E; Eren, A Murat.

Cell ; 187(5): 1206-1222.e16, 2024 Feb 29.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38428395

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10973873
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.01.039

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2.

Infant microbes and metabolites point to childhood neurodevelopmental disorders.

Ahrens, Angelica P; Hyötyläinen, Tuulia; Petrone, Joseph R; Igelström, Kajsa; George, Christian D; Garrett, Timothy J; Oresic, Matej; Triplett, Eric W; Ludvigsson, Johnny.

Cell ; 187(8): 1853-1873.e15, 2024 Apr 11.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38574728

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3.

Gut microbiome and metabolome profiling in Framingham heart study reveals cholesterol-metabolizing bacteria.

Li, Chenhao; Strazar, Martin; Mohamed, Ahmed M T; Pacheco, Julian A; Walker, Rebecca L; Lebar, Tina; Zhao, Shijie; Lockart, Julia; Dame, Andrea; Thurimella, Kumar; Jeanfavre, Sarah; Brown, Eric M; Ang, Qi Yan; Berdy, Brittany; Sergio, Dallis; Invernizzi, Rachele; Tinoco, Antonio; Pishchany, Gleb; Vasan, Ramachandran S; Balskus, Emily; Huttenhower, Curtis; Vlamakis, Hera; Clish, Clary; Shaw, Stanley Y; Plichta, Damian R; Xavier, Ramnik J.

Cell ; 187(8): 1834-1852.e19, 2024 Apr 11.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38569543

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC11071153
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.03.014

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4.

Fecal microbiota-based treatment for recurrent Clostridioides difficile infection.

Walter, Jens; Shanahan, Fergus.

Cell ; 186(6): 1087, 2023 03 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36931236

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5.

High-resolution analyses of associations between medications, microbiome, and mortality in cancer patients.

Nguyen, Chi L; Markey, Kate A; Miltiadous, Oriana; Dai, Anqi; Waters, Nicholas; Sadeghi, Keimya; Fei, Teng; Shouval, Roni; Taylor, Bradford P; Liao, Chen; Slingerland, John B; Slingerland, Ann E; Clurman, Annelie G; Maloy, Molly A; Bohannon, Lauren; Giardina, Paul A; Brereton, Daniel G; Armijo, Gabriel K; Fontana, Emily; Gradissimo, Ana; Gyurkocza, Boglarka; Sung, Anthony D; Chao, Nelson J; Devlin, Sean M; Taur, Ying; Giralt, Sergio A; Perales, Miguel-Angel; Xavier, Joao B; Pamer, Eric G; Peled, Jonathan U; Gomes, Antonio L C; van den Brink, Marcel R M.

Cell ; 186(12): 2705-2718.e17, 2023 06 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37295406

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10390075
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2023.05.007

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6.

A distinct clade of Bifidobacterium longum in the gut of Bangladeshi children thrives during weaning.

Vatanen, Tommi; Ang, Qi Yan; Siegwald, Léa; Sarker, Shafiqul Alam; Le Roy, Caroline I; Duboux, Stéphane; Delannoy-Bruno, Omar; Ngom-Bru, Catherine; Boulangé, Claire L; Strazar, Martin; Avila-Pacheco, Julian; Deik, Amy; Pierce, Kerry; Bullock, Kevin; Dennis, Courtney; Sultana, Shamima; Sayed, Sharika; Rahman, Mahbubar; Ahmed, Tahmeed; Modesto, Monica; Mattarelli, Paola; Clish, Clary B; Vlamakis, Hera; Plichta, Damian R; Sakwinska, Olga; Xavier, Ramnik J.

Cell ; 185(23): 4280-4297.e12, 2022 11 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36323316

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7.

Design, construction, and in vivo augmentation of a complex gut microbiome.

Cheng, Alice G; Ho, Po-Yi; Aranda-Díaz, Andrés; Jain, Sunit; Yu, Feiqiao B; Meng, Xiandong; Wang, Min; Iakiviak, Mikhail; Nagashima, Kazuki; Zhao, Aishan; Murugkar, Pallavi; Patil, Advait; Atabakhsh, Katayoon; Weakley, Allison; Yan, Jia; Brumbaugh, Ariel R; Higginbottom, Steven; Dimas, Alejandra; Shiver, Anthony L; Deutschbauer, Adam; Neff, Norma; Sonnenburg, Justin L; Huang, Kerwyn Casey; Fischbach, Michael A.

Cell ; 185(19): 3617-3636.e19, 2022 09 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36070752

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9691261
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2022.08.003

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8.

Mobile genetic elements from the maternal microbiome shape infant gut microbial assembly and metabolism.

Vatanen, Tommi; Jabbar, Karolina S; Ruohtula, Terhi; Honkanen, Jarno; Avila-Pacheco, Julian; Siljander, Heli; Strazar, Martin; Oikarinen, Sami; Hyöty, Heikki; Ilonen, Jorma; Mitchell, Caroline M; Yassour, Moran; Virtanen, Suvi M; Clish, Clary B; Plichta, Damian R; Vlamakis, Hera; Knip, Mikael; Xavier, Ramnik J.

Cell ; 185(26): 4921-4936.e15, 2022 12 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36563663

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9869402
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2022.11.023

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9.

Autism-related dietary preferences mediate autism-gut microbiome associations.

Yap, Chloe X; Henders, Anjali K; Alvares, Gail A; Wood, David L A; Krause, Lutz; Tyson, Gene W; Restuadi, Restuadi; Wallace, Leanne; McLaren, Tiana; Hansell, Narelle K; Cleary, Dominique; Grove, Rachel; Hafekost, Claire; Harun, Alexis; Holdsworth, Helen; Jellett, Rachel; Khan, Feroza; Lawson, Lauren P; Leslie, Jodie; Frenk, Mira Levis; Masi, Anne; Mathew, Nisha E; Muniandy, Melanie; Nothard, Michaela; Miller, Jessica L; Nunn, Lorelle; Holtmann, Gerald; Strike, Lachlan T; de Zubicaray, Greig I; Thompson, Paul M; McMahon, Katie L; Wright, Margaret J; Visscher, Peter M; Dawson, Paul A; Dissanayake, Cheryl; Eapen, Valsamma; Heussler, Helen S; McRae, Allan F; Whitehouse, Andrew J O; Wray, Naomi R; Gratten, Jacob.

Cell ; 184(24): 5916-5931.e17, 2021 11 24.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34767757

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10.

Bifidobacteria-mediated immune system imprinting early in life.

Henrick, Bethany M; Rodriguez, Lucie; Lakshmikanth, Tadepally; Pou, Christian; Henckel, Ewa; Arzoomand, Aron; Olin, Axel; Wang, Jun; Mikes, Jaromir; Tan, Ziyang; Chen, Yang; Ehrlich, Amy M; Bernhardsson, Anna Karin; Mugabo, Constantin Habimana; Ambrosiani, Ylva; Gustafsson, Anna; Chew, Stephanie; Brown, Heather K; Prambs, Johann; Bohlin, Kajsa; Mitchell, Ryan D; Underwood, Mark A; Smilowitz, Jennifer T; German, J Bruce; Frese, Steven A; Brodin, Petter.

Cell ; 184(15): 3884-3898.e11, 2021 07 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34143954

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11.

The long-term genetic stability and individual specificity of the human gut microbiome.

Chen, Lianmin; Wang, Daoming; Garmaeva, Sanzhima; Kurilshikov, Alexander; Vich Vila, Arnau; Gacesa, Ranko; Sinha, Trishla; Segal, Eran; Weersma, Rinse K; Wijmenga, Cisca; Zhernakova, Alexandra; Fu, Jingyuan.

Cell ; 184(9): 2302-2315.e12, 2021 04 29.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33838112

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12.

Elevated rates of horizontal gene transfer in the industrialized human microbiome.

Groussin, Mathieu; Poyet, Mathilde; Sistiaga, Ainara; Kearney, Sean M; Moniz, Katya; Noel, Mary; Hooker, Jeff; Gibbons, Sean M; Segurel, Laure; Froment, Alain; Mohamed, Rihlat Said; Fezeu, Alain; Juimo, Vanessa A; Lafosse, Sophie; Tabe, Francis E; Girard, Catherine; Iqaluk, Deborah; Nguyen, Le Thanh Tu; Shapiro, B Jesse; Lehtimäki, Jenni; Ruokolainen, Lasse; Kettunen, Pinja P; Vatanen, Tommi; Sigwazi, Shani; Mabulla, Audax; Domínguez-Rodrigo, Manuel; Nartey, Yvonne A; Agyei-Nkansah, Adwoa; Duah, Amoako; Awuku, Yaw A; Valles, Kenneth A; Asibey, Shadrack O; Afihene, Mary Y; Roberts, Lewis R; Plymoth, Amelie; Onyekwere, Charles A; Summons, Roger E; Xavier, Ramnik J; Alm, Eric J.

Cell ; 184(8): 2053-2067.e18, 2021 04 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33794144

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13.

Human gut mycobiota tune immunity via CARD9-dependent induction of anti-fungal IgG antibodies.

Doron, Itai; Leonardi, Irina; Li, Xin V; Fiers, William D; Semon, Alexa; Bialt-DeCelie, Meghan; Migaud, Mélanie; Gao, Iris H; Lin, Woan-Yu; Kusakabe, Takato; Puel, Anne; Iliev, Iliyan D.

Cell ; 184(4): 1017-1031.e14, 2021 02 18.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33548172

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7936855
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.016

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14.

A selective antibiotic for Lyme disease.

Leimer, Nadja; Wu, Xiaoqian; Imai, Yu; Morrissette, Madeleine; Pitt, Norman; Favre-Godal, Quentin; Iinishi, Akira; Jain, Samta; Caboni, Mariaelena; Leus, Inga V; Bonifay, Vincent; Niles, Samantha; Bargabos, Rachel; Ghiglieri, Meghan; Corsetti, Rachel; Krumpoch, Megan; Fox, Gabriel; Son, Sangkeun; Klepacki, Dorota; Polikanov, Yury S; Freliech, Cecily A; McCarthy, Julie E; Edmondson, Diane G; Norris, Steven J; D'Onofrio, Anthony; Hu, Linden T; Zgurskaya, Helen I; Lewis, Kim.

Cell ; 184(21): 5405-5418.e16, 2021 10 14.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34619078

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8526400
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.09.011

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15.

Dissecting the contribution of host genetics and the microbiome in complex behaviors.

Buffington, Shelly A; Dooling, Sean W; Sgritta, Martina; Noecker, Cecilia; Murillo, Oscar D; Felice, Daniela F; Turnbaugh, Peter J; Costa-Mattioli, Mauro.

Cell ; 184(7): 1740-1756.e16, 2021 04 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33705688

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8996745
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.02.009

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16.

Dysregulation of ILC3s unleashes progression and immunotherapy resistance in colon cancer.

Goc, Jeremy; Lv, Mengze; Bessman, Nicholas J; Flamar, Anne-Laure; Sahota, Sheena; Suzuki, Hiroaki; Teng, Fei; Putzel, Gregory G; Eberl, Gerard; Withers, David R; Arthur, Janelle C; Shah, Manish A; Sonnenberg, Gregory F.

Cell ; 184(19): 5015-5030.e16, 2021 09 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34407392

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8454863
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.07.029

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17.

Maternal Fecal Microbiota Transplantation in Cesarean-Born Infants Rapidly Restores Normal Gut Microbial Development: A Proof-of-Concept Study.

Korpela, Katri; Helve, Otto; Kolho, Kaija-Leena; Saisto, Terhi; Skogberg, Kirsi; Dikareva, Evgenia; Stefanovic, Vedran; Salonen, Anne; Andersson, Sture; de Vos, Willem M.

Cell ; 183(2): 324-334.e5, 2020 10 15.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33007265

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18.

Propionic Acid Shapes the Multiple Sclerosis Disease Course by an Immunomodulatory Mechanism.

Duscha, Alexander; Gisevius, Barbara; Hirschberg, Sarah; Yissachar, Nissan; Stangl, Gabriele I; Dawin, Eva; Bader, Verian; Haase, Stefanie; Kaisler, Johannes; David, Christina; Schneider, Ruth; Troisi, Riccardo; Zent, Daniel; Hegelmaier, Tobias; Dokalis, Nikolaos; Gerstein, Sara; Del Mare-Roumani, Sara; Amidror, Sivan; Staszewski, Ori; Poschmann, Gereon; Stühler, Kai; Hirche, Frank; Balogh, Andras; Kempa, Stefan; Träger, Pascal; Zaiss, Mario M; Holm, Jacob Bak; Massa, Megan G; Nielsen, Henrik Bjørn; Faissner, Andreas; Lukas, Carsten; Gatermann, Sören G; Scholz, Markus; Przuntek, Horst; Prinz, Marco; Forslund, Sofia K; Winklhofer, Konstanze F; Müller, Dominik N; Linker, Ralf A; Gold, Ralf; Haghikia, Aiden.

Cell ; 180(6): 1067-1080.e16, 2020 03 19.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32160527

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19.

Longitudinal Multi-omics Reveals Subset-Specific Mechanisms Underlying Irritable Bowel Syndrome.

Mars, Ruben A T; Yang, Yi; Ward, Tonya; Houtti, Mo; Priya, Sambhawa; Lekatz, Heather R; Tang, Xiaojia; Sun, Zhifu; Kalari, Krishna R; Korem, Tal; Bhattarai, Yogesh; Zheng, Tenghao; Bar, Noam; Frost, Gary; Johnson, Abigail J; van Treuren, Will; Han, Shuo; Ordog, Tamas; Grover, Madhusudan; Sonnenburg, Justin; D'Amato, Mauro; Camilleri, Michael; Elinav, Eran; Segal, Eran; Blekhman, Ran; Farrugia, Gianrico; Swann, Jonathan R; Knights, Dan; Kashyap, Purna C.

Cell ; 182(6): 1460-1473.e17, 2020 09 17.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32916129

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8109273
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.08.007

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20.

Personalized Mapping of Drug Metabolism by the Human Gut Microbiome.

Javdan, Bahar; Lopez, Jaime G; Chankhamjon, Pranatchareeya; Lee, Ying-Chiang J; Hull, Raphaella; Wu, Qihao; Wang, Xiaojuan; Chatterjee, Seema; Donia, Mohamed S.

Cell ; 181(7): 1661-1679.e22, 2020 06 25.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32526207

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8591631
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.001

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