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Boto, a class II transposon in Moniliophthora perniciosa, is the first representative of the PIF/Harbinger superfamily in a phytopathogenic fungus.
Pereira, Jorge Fernando; Almeida, Ana Paula Morais Martins; Cota, Júnio; Pamphile, João Alencar; Ferreira da Silva, Gilvan; de Araújo, Elza Fernandes; Gramacho, Karina Peres; Brommonschenkel, Sérgio Hermínio; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães; de Queiroz, Marisa Vieira.
Afiliação
  • Pereira JF; Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Microbiologia, CEP 36571-000, Viçosa, MG, Brazil.
  • Almeida APMM; Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Microbiologia, CEP 36571-000, Viçosa, MG, Brazil.
  • Cota J; Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Microbiologia, CEP 36571-000, Viçosa, MG, Brazil.
  • Pamphile JA; Universidade Estadual de Maringá, Departamento de Biologia Celular e Genética, CEP 87020-900, Maringá, PR, Brazil.
  • Ferreira da Silva G; Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Microbiologia, CEP 36571-000, Viçosa, MG, Brazil.
  • de Araújo EF; Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Microbiologia, CEP 36571-000, Viçosa, MG, Brazil.
  • Gramacho KP; CEPLAC, Centro de Pesquisa do Cacau, CEP 45600-000, Itabuna, BA, Brazil.
  • Brommonschenkel SH; Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Fitopatologia, CEP 36571-000, Viçosa, MG, Brazil.
  • Pereira GAG; Universidade Estadual de Campinas, Departamento de Genética e Evolução, CEP 13083-970, Campinas, SP, Brazil.
  • de Queiroz MV; Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Microbiologia, CEP 36571-000, Viçosa, MG, Brazil.
Microbiology (Reading) ; 159(Pt 1): 112-125, 2013 Jan.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-23103978
ABSTRACT
Boto, a class II transposable element, was characterized in the Moniliophthora perniciosa genome. The Boto transposase is highly similar to plant PIF-like transposases that belong to the newest class II superfamily known as PIF/Harbinger. Although Boto shares characteristics with PIF-like elements, other characteristics, such as the transposase intron position, the position and direction of the second ORF, and the footprint, indicate that Boto belongs to a novel family of the PIF/Harbinger superfamily. Southern blot analyses detected 6-12 copies of Boto in C-biotype isolates and a ubiquitous presence among the C- and S-biotypes, as well as a separation in the C-biotype isolates from Bahia State in Brazil in at least two genotypic groups, and a new insertion in the genome of a C-biotype isolate maintained in the laboratory for 6 years. In addition to PCR amplification from a specific insertion site, changes in the Boto hybridization profile after the M. perniciosa sexual cycle and detection of Boto transcripts gave further evidence of Boto activity. As an active family in the genome of M. perniciosa, Boto elements may contribute to genetic variability in this homothallic fungus. This is the first report of a PIF/Harbinger transposon in the genome of a phytopathogenic fungus.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article