Structural comparison of AP endonucleases from the exonuclease III family reveals new amino acid residues in human AP endonuclease 1 that are involved in incision of damaged DNA.

Redrejo-Rodríguez, Modesto; Vigouroux, Armelle; Mursalimov, Aibek; Grin, Inga; Alili, Doria; Koshenov, Zhanat; Akishev, Zhiger; Maksimenko, Andrei; Bissenbaev, Amangeldy K; Matkarimov, Bakhyt T; Saparbaev, Murat; Ishchenko, Alexander A; Moréra, Solange

Redrejo-Rodríguez, Modesto; Vigouroux, Armelle; Mursalimov, Aibek; Grin, Inga; Alili, Doria; Koshenov, Zhanat; Akishev, Zhiger; Maksimenko, Andrei; Bissenbaev, Amangeldy K; Matkarimov, Bakhyt T; Saparbaev, Murat; Ishchenko, Alexander A; Moréra, Solange.

Afiliação

Redrejo-Rodríguez M; Laboratoire «Stabilité Génétique et Oncogenèse¼ CNRS, UMR 8200, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Cancer Campus, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, F-94805 Villejuif Cedex, France.
Vigouroux A; Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC), CNRS CEA Univ Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette 91198, France.
Mursalimov A; National Laboratory Astana, Nazarbayev University, Astana 010000, Kazakhstan.
Grin I; Laboratoire «Stabilité Génétique et Oncogenèse¼ CNRS, UMR 8200, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Cancer Campus, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, F-94805 Villejuif Cedex, France; SB RAS Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk 630090, Russia
Alili D; Laboratoire «Stabilité Génétique et Oncogenèse¼ CNRS, UMR 8200, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Cancer Campus, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, F-94805 Villejuif Cedex, France.
Koshenov Z; National Laboratory Astana, Nazarbayev University, Astana 010000, Kazakhstan.
Akishev Z; Department of Molecular Biology and Genetics, Faculty of Biology, Al-Farabi Kazakh National University, Almaty 530038, Kazakhstan.
Maksimenko A; Laboratoire «Stabilité Génétique et Oncogenèse¼ CNRS, UMR 8200, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Cancer Campus, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, F-94805 Villejuif Cedex, France.
Bissenbaev AK; Department of Molecular Biology and Genetics, Faculty of Biology, Al-Farabi Kazakh National University, Almaty 530038, Kazakhstan.
Matkarimov BT; National Laboratory Astana, Nazarbayev University, Astana 010000, Kazakhstan.
Saparbaev M; Laboratoire «Stabilité Génétique et Oncogenèse¼ CNRS, UMR 8200, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Cancer Campus, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, F-94805 Villejuif Cedex, France.
Ishchenko AA; Laboratoire «Stabilité Génétique et Oncogenèse¼ CNRS, UMR 8200, Univ. Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gustave Roussy Cancer Campus, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, F-94805 Villejuif Cedex, France. Electronic address: alexander.ishchenko@gustaveroussy.fr.
Moréra S; Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC), CNRS CEA Univ Paris-Sud, Université Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette 91198, France. Electronic address: solange.morera@i2bc.paris-saclay.fr.

Biochimie ; 128-129: 20-33, 2016.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27343627

Assuntos

Aminoácidos/genética; Proteínas de Bactérias/genética; Dano ao DNA; Reparo do DNA; DNA Liase (Sítios Apurínicos ou Apirimidínicos)/genética; Exodesoxirribonucleases/genética; Sequência de Aminoácidos; Aminoácidos/química; Aminoácidos/metabolismo; Bacillus subtilis/enzimologia; Bacillus subtilis/genética; Proteínas de Bactérias/química; Proteínas de Bactérias/metabolismo; Sítios de Ligação/genética; Biocatálise; Domínio Catalítico; Cristalografia por Raios X; DNA Liase (Sítios Apurínicos ou Apirimidínicos)/química; DNA Liase (Sítios Apurínicos ou Apirimidínicos)/metabolismo; Proteínas de Escherichia coli/química; Proteínas de Escherichia coli/genética; Proteínas de Escherichia coli/metabolismo; Exodesoxirribonucleases/química; Exodesoxirribonucleases/metabolismo; Humanos; Cinética; Modelos Moleculares; Mutação; Oligonucleotídeos/genética; Oligonucleotídeos/metabolismo; Domínios Proteicos; Homologia de Sequência de Aminoácidos; Especificidade por Substrato

Palavras-chave

AP endonuclease; Base excision repair; Crystal structure; Nucleotide incision repair; Oxidative DNA damage

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