Identification of ligand binding activity and DNA recognition by RhlR protein from opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa-a molecular dynamic simulation approach.

Chowdhury, Nilkanta; Bagchi, Angshuman

Chowdhury, Nilkanta; Bagchi, Angshuman.

Afiliação

Chowdhury N; Department of Biochemistry and Biophysics, University of Kalyani, Nadia, India.
Bagchi A; Department of Biochemistry and Biophysics, University of Kalyani, Nadia, India.

J Mol Recognit ; 31(12): e2738, 2018 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29968257

Assuntos

4-Butirolactona/análogos & derivados; Proteínas de Bactérias/química; Proteínas de Bactérias/metabolismo; DNA Bacteriano/metabolismo; Pseudomonas aeruginosa/metabolismo; 4-Butirolactona/metabolismo; Sítios de Ligação; DNA Bacteriano/genética; Regulação Bacteriana da Expressão Gênica; Ligantes; Modelos Moleculares; Simulação de Dinâmica Molecular; Regiões Promotoras Genéticas; Ligação Proteica; Multimerização Proteica; Pseudomonas aeruginosa/genética; Transcrição Gênica

Palavras-chave

Autoinducer ligand; DNA-protein interactions; MD simulation; RhlR protein; protein-protein interactions

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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