Integrated Chip-Seq and RNA-Seq Data Analysis Coupled with Bioinformatics Approaches to Investigate Regulatory Landscape of Transcription Modulators in Breast Cancer Cells.

Ramos, Jairo; Felty, Quentin; Roy, Deodutta

Ramos, Jairo; Felty, Quentin; Roy, Deodutta.

Afiliação

Ramos J; Department of Environmental Health Sciences, Florida International University, Miami, FL, USA.
Felty Q; Department of Environmental Health Sciences, Florida International University, Miami, FL, USA.
Roy D; Department of Environmental Health Sciences, Florida International University, Miami, FL, USA. Droy@fiu.edu.

Methods Mol Biol ; 2102: 35-59, 2020.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31989549

Assuntos

Neoplasias da Mama/genética; Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação/métodos; Genômica/métodos; RNA-Seq/métodos; Sítios de Ligação; Neoplasias da Mama/metabolismo; Carcinogênese/genética; Feminino; Regulação Neoplásica da Expressão Gênica; Humanos; Proteínas Inibidoras de Diferenciação/genética; Proteínas Inibidoras de Diferenciação/metabolismo; Proteínas de Neoplasias/genética; Proteínas de Neoplasias/metabolismo; Fator 1 Nuclear Respiratório/genética; Fator 1 Nuclear Respiratório/metabolismo; Regiões Promotoras Genéticas; Software

Palavras-chave

Bioinformatics; ID3; Integrated ChIP-Seq and RNA-Seq; NRF1; Transcription factor

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Female / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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