RNA-Seq Data Analysis in Galaxy.

Batut, Bérénice; van den Beek, Marius; Doyle, Maria A; Soranzo, Nicola

Batut, Bérénice; van den Beek, Marius; Doyle, Maria A; Soranzo, Nicola.

Afiliação

Batut B; Bioinformatics Group, Department of Computer Science, Albert-Ludwigs-University Freiburg, Freiburg, Germany.
van den Beek M; Department of Biochemistry and Molecular Biology, Penn State University, University Park, PA, USA.
Doyle MA; Research Computing Facility, Peter MacCallum Cancer Centre, Melbourne, VIC, Australia.
Soranzo N; Sir Peter MacCallum Department of Oncology, The University of Melbourne, Melbourne, VIC, Australia.

Methods Mol Biol ; 2284: 367-392, 2021.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33835453

Assuntos

RNA-Seq/métodos; Software; Animais; Biologia Computacional/métodos; Análise de Dados; Conjuntos de Dados como Assunto/estatística & dados numéricos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Perfilação da Expressão Gênica/estatística & dados numéricos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/estatística & dados numéricos; Humanos; Reprodutibilidade dos Testes; Análise de Sequência de RNA/métodos; Análise de Sequência de RNA/estatística & dados numéricos; Sequenciamento do Exoma/métodos; Sequenciamento do Exoma/estatística & dados numéricos

Palavras-chave

Differential gene expression; Functional enrichment; Galaxy; Quality control; Sequence mapping; Visualizations; Workflow

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Limite: Animals / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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