Draft Genome Sequence of a Pathogenic Vibrio vulnificus Strain Isolated in Brazil.

We describe the draft genome sequence of the clinical Vibrio vulnificus strain 03_7315, isolated in 2016 from the blood of a diabetic patient who died of septicemia after ingestion of seafood. The draft genome, with 4,755,588 bp covering two chromosomes, presented 4,434 genes, 4,213 coding sequences, and 117 pseudogenes.

Prevalence, Risk Factors and Molecular Characteristics of Meningococcal Carriage Among Brazilian Adolescents.

BACKGROUND: In 2010, introduction of the meningococcal C conjugate vaccine in Brazil for children <2 years provided an immediate reduction in the incidence rates of disease among the age groups targeted for the vaccine, but no early impact was observed in unvaccinated age groups. Knowledge about meningococcal carriage is crucial for improving our understanding of the disease epidemiology and for designing effective vaccination programs. Taking in account the very limited published data currently available describing meningococcal carriage in Brazil, we performed a study to evaluate the prevalence of Neisseria meningitidis carriage among adolescent students. METHODS: A cross-sectional study was conducted in 2012 to assess the prevalence of meningococcal carriage among a representative sample of 1208 students 11-19 years of age in Campinas, Brazil. Genotypic and phenotypic characterization of isolated carriage strains and the effect of potential risk factors for carriage were also analyzed. RESULTS: The overall carriage prevalence was 9.9% (95% confidence interval, 8.3-11.8%), with dominance of serogroup C (1.32%), followed by serogroups B (0.99%), E (0.74%), Y (0.49%) and W (0.25%). A lower level of education of the parents was independently associated with a higher risk of carriage. A high diversity of genotypes was found among carriage strains. CONCLUSIONS: The evidence gathered during this study provides estimates of carriage prevalence in Brazilian adolescents, showing an unusually high dominance of serogroup C. These results have important implications in future strategies to optimize the impact of the current meningococcal C vaccination program in Brazil.

Salmonella Enteritidis: importância do inquérito epidemiológico, análise de alimentos e coprocultura na elucidação de 167 surtos alimentares / Salmonella Enteritidis: the significance of the epidemiological investigation, analysis of food and fecal culture for elucidating 167 foodborne outbreaks

A infecção humana por Salmonella Enteritidis está associada ao consumo de ovos crus ou mal cozidos e seus derivados e, a partir de 1993, emergiu como um problema de saúde pública no Brasil. Neste trabalho foram analisados os surtos por S. Enteritidis ocorridos entre os anos de 1995 e 2008 na região sudeste do Estado de São Paulo, bem como a importância da elaboração do inquérito epidemiológico para a sua elucidação. A análise conjunta de dados resultantes de análises de alimentos, coprocultura e dos inquéritos recebidos pelo laboratório mostrou a ocorrência de 167 surtos positivos para S. Enteritidis, dos quais foram obtidos 59(35,3%) inquéritos epidemiológicos. Do total de surtos, 48 (28,7%) foram elucidados somente pela análise de alimentos; 25 (15%) pela análise de alimentos e coprocultura, e 94 (56,3%) somente por coprocultura. Dentre os alimentos envolvidos nos surtos, o mais frequente foi a maionese caseira (58,2%). Verifica-se a continuidade no desconhecimento da população em relação ao consumo de alimentos que contenham ovos crus ou mal cozidos e a necessidade de introduzir melhorias na investigação epidemiológica dos surtos, para que se possa identificar a fonte de infecção no maior número possível dessas ocorrências.

Human illness caused by infection with Salmonella Enteritidis associated with egg products increasedworldwide beginning as early as the mid-70s, and by 1990 this serovar was the primary cause of salmonellosisin the world. This study reports the foodborne outbreaks caused by Salmonella Enteritidis occurred in thesoutheastern region of São Paulo State, Brazil, from 1995 to 2008. Also, the importance of the epidemiologicalinvestigation to elucidate the foodborne outbreaks is considered. The combined analysis on the data fromthe food culture, the feces culture and the epidemiological inquiries showed the occurrence of 167 S.Enteritidis-positive outbreaks, based on 59 (35.3%) epidemiological inquiries only. Of 167 outbreaks, 48(28.7%) were elucidated by food analysis only; 25 (15%) by food and feces analysis; and 94 (56.3%) by fecesculture only. Epidemiological and microbiological investigations showed that the home-made mayonnaise(58.2%) was the most frequent food being as the vehicle of infection. The epidemiological investigation offoodborne outbreaks should be improved by implementing the data, the foods and biological specimenscollecting procedures, and also, people should be instructed about the risks of consuming foods containingraw or under cooked eggs.

Pheno- and genotypic characterization of Listeria monocytogenes clinical isolates from the southwestern region of the State of São Paulo, Brazil

Considering the lack of information available in Brazil concerning listeriosis, the present study aimed to analyze phenotypic and genotypically Listeria monocytogenes clinical isolates from the Southwestern region of the State of São Paulo, Brazil. From January 1995 to May 2005, thirteen isolates of L. monocytogenes from twelve patients with listeriosis were sent to the Adolfo Lutz Institute (Campinas Regional Laboratory, São Paulo, Brazil). The antimicrobial susceptibility of the isolates was evaluated by the microdilution broth method for ampicillin, gentamicin, trimethoprim, sulfamethoxazole and vancomycin. They were also serotyped (Denka Seiken, Japan), and sub-typed by PFGE employing ApaI and AscI and the American CDC protocol. None of the isolates showed resistance to the antibiotics tested; however, seven of them presented increased values for sulfamethoxazole MICs. Ten isolates belonged to serotype 4b, two to serotype 1/2a and only one to serotype 1/2b. After digestion with ApaI and AscI, the strains were distributed in 3 different groups according to their profile. It was observed that the spatial or temporally unrelated strains exhibited similar PFGE profiles, indicating a possible clonal relationship among them.

No Brasil, dados sobre a ocorrência de surtos ou casos esporádicos de listeriose são raros, assim como estudos que tratem da caracterização de cepas de L. monocytogenes isoladas destes episódios. Desta forma, o presente estudo teve por objetivo avaliar feno e genotipicamente 13 cepas de Listeria monocytogenes isoladas de 12 casos clínicos de listeriose ocorridos em 6 municípios da região sudoeste do Estado de São Paulo, Brasil, no período de janeiro de 1995 a maio de 2005. As cepas foram submetidas ao teste de sensibilidade a cinco antimicrobianos (ampicilina, gentamicina, trimetoprim, sulfametoxazol e vancomicina) pelo método de microdiluição em caldo; à sorotipagem (Denka Seiken, Japão) e à determinação do perfil de macro-restrição por eletroforese em campo pulsado (PFGE, Pulsenet, CDC, USA, 2001). Nenhuma das cepas foi resistente aos antimicrobianos testados; entretanto, sete tiveram valores da CIM aumentados para o sulfametoxazol. Dez cepas pertenciam ao sorotipo 4b, duas ao sorotipo 1/2a e apenas uma ao sorotipo 1/2b. Com o emprego da técnica de PFGE e as enzimas Apa I e Asc I as cepas foram separadas em três grupos diferentes, de acordo com seus perfis moleculares. É interessante destacar que cepas não relacionadas (temporal ou espacialmente) apresentaram perfis moleculares semelhantes indicando uma possível relação clonal entre elas.

O uso de equipamentos de proteção individual (EPIs) e coletiva (EPCs) nos acidentes ocorridos em um laboratório de saúde pública no período de maio de 1998 a maio de 2002 / Individual and collective protection equipments (IPE and CPE) wearing in a health public laboratory accidents from may 1998 to may 2002

A saúde dos trabalhadores tem merecido atenção do Sistema Nacional de Saúde e de organizações internacionais. Este estudo teve como objetivo avaliar os 38 acidentes registrados no período de maio de 1998 a maio de 2002 num laboratório de saúde pública, a relação com o não uso ou o uso inadequado de EPIs e EPCs pelos funcionários e a quantidade de horas trabalhadas pelos profissionais quando da ocorrência dos acidentes. Os dados foram obtidos nas fichas de registro de acidentes de trabalho elaboradas pelo grupo de biossegurança local e preenchidas durante entrevista com os acidentados. Os acidentes foram agrupados segundo a sua natureza, em cinco categorias: queimaduras (calor, frio, ácido); pérfuro-cortantes; amostras biológicas; transporte de amostras; incêndios. Foram registrados 38 acidentes envolvendo 30 pessoas, sendo: 7 casos (18,42 por cento) em 1998 (maio a dezembro); 10 (26,32 por cento) em 1999; 7 (18,42 por cento) em 2000; 7 (18,42 por cento) em 2001 e 7 (18,42 por cento) em 2002 (janeiro a maio). O acidente mais frequente (37 por cento) ocorreu com amostras biológicas, seguido pelos pérfuro-cortantes (24 por cento). Os EPIs estavam sendo utilizados de maneira incorreta ou incompleta em 22 dos acidentes relatados. Conclui-se, portanto, que é de fundamental importância a prevenção de acidentes frente a situações de risco em laboratório, e que a conscientização e responsabilidade na observação das normas de biossegurança envolve os profissionais em todos os níves