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Microbiologyopen ; 6(4)2017 08.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28326685

RESUMO

The human gut is composed of a large diversity of microorganisms, which have been poorly described. Here, using culturomics, a new concept based on the variation in culture conditions and MALDI-TOF MS identification, we proceed to explore the microbial diversity of the complex ecosystem of the human gut. Using this approach, we isolated strain AT8T (=CSUR P2118 =  DSM 101782) from stool specimens collected from a 51-year-old obese French woman. Strain AT8T is a strictly anaerobic, nonmotile, nonspore-forming gram-positive coccus that do not exhibit catalase and oxidase activities. 16S rDNA-based identification of strain AT8T demonstrated 92% gene sequence similarity with Eggerthella lenta DSM 2243, the phylogenetically closed validly named type species. Here, we present a set of features for the strain AT8T and the description of its complete genome sequence and annotation. The 2,091,845 bp long genome has a G+C content of 63.46% and encodes1,849 predicted genes; 1,781 were protein-coding genes, and 68 were RNAs. On the basis of the characteristics reported here, we propose the creation of a new bacterial genus Hugonella gen. nov., belonging to the Eggerthellaceae family and including Hugonella massiliensis gen. nov., sp. nov., strain AT8T as the type strain.


Assuntos
Actinobacteria/classificação , Actinobacteria/isolamento & purificação , Trato Gastrointestinal/microbiologia , Sequenciamento Completo do Genoma , Actinobacteria/química , Actinobacteria/genética , Anaerobiose , Composição de Bases , Análise por Conglomerados , DNA Ribossômico/química , DNA Ribossômico/genética , Fezes/microbiologia , Feminino , França , Humanos , Pessoa de Meia-Idade , Anotação de Sequência Molecular , Filogenia , RNA Ribossômico 16S/genética , Análise de Sequência de DNA , Espectrometria de Massas por Ionização e Dessorção a Laser Assistida por Matriz
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