RESUMO
Next-Generation Sequencing has recently been introduced to efficiently and simultaneously detect genetic variations in acute myeloid leukemia. However, its implementation in the clinical routine raises new challenges focused on the diversity of assays and variant reporting criteria. To overcome this challenge, the PETHEMA group established a nationwide network of reference laboratories aimed to deliver molecular results in the clinics. We report the technical cross-validation results for next-generation sequencing panel genes during the standardization process and the clinical validation in 823 samples of 751 patients with newly diagnosed or refractory/relapse acute myeloid leukemia. Two cross-validation rounds were performed in seven nationwide reference laboratories in order to reach a consensus regarding quality metrics criteria and variant reporting. In the pre-standardization cross-validation round, an overall concordance of 60.98% was obtained with a great variability in selected genes and conditions across laboratories. After consensus of relevant genes and optimization of quality parameters the overall concordance rose to 85.57% in the second cross-validation round. We show that a diagnostic network with harmonized next-generation sequencing analysis and reporting in seven experienced laboratories is feasible in the context of a scientific group. This cooperative nationwide strategy provides advanced molecular diagnostic for acute myeloid leukemia patients of the PETHEMA group.
Assuntos
Leucemia Mieloide Aguda , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Humanos , Leucemia Mieloide Aguda/diagnóstico , Leucemia Mieloide Aguda/genética , Mutação , RecidivaRESUMO
Fundamento: Estudiar la prevalencia de anticuerpos antifosfolipídicos y analizar su relación con la progresión de la hepatitis crónica por virus C. Métodos: Se incluyen 128 pacientes con hepatopatía crónica por VHC (edad 46 [14] años, 70 varones), no tratados con interferón y un grupo control sano de 93 personas. Analizamos los factores de riesgo, la duración de la enfermedad, el consumo de alcohol, la cifra de plaquetas, ALT, ARN del VHC en suero e hígado y anticuerpos antinucleares, el grado de inflamación y el estadio de fibrosis en la biopsia hepática, el estadio de Child-Pugh, la existencia de hipertensión portal y descompensaciones previas. Estudiamos la presencia de anticoagulante lúpico y anticuerpos anticardiolipina (ACA) IgG e IgM. En los pacientes con anticuerpos anticardiolipina positivos se detectó la presencia de anti-ß glucoproteína I mediante ELISA. Resultados: Presentaron anticuerpos antifosfolipídicos positivos 31/128 (25 por ciento; intervalo de confianza [IC] del 95 por ciento: 17,8-33,4). La prevalencia de anticuerpos anticardiolipina IgG fue significativamente mayor en pacientes (22 por ciento) que en controles 3/93 (3,2 por ciento), p < 0,05; en cambio, no encontramos diferencias en la prevalencia de anticuerpos anticardiolipina IgM ni de anticoagulante lúpico. No encontramos diferencias en las cifras de ALT, viremia, carga viral en hígado, plaquetas o ANA en los pacientes con anticuerpos anticardiolipina IgG o sin ellos, tampoco apreciamos relación con la edad, la duración de la infección, el consumo de alcohol ni los factores de riesgo. En 4 de 44 pacientes (9 por ciento, IC del 95 por ciento: 2,5-21,7) con fibrosis F1, en 7 de 39 (18 por ciento; IC del 95 por ciento: 7,5-33,5) con F2 y en 17 de 45 (38 por ciento; IC del 95 por ciento: 23,8-53,5) con cirrosis encontramos anticuerpos anticardiolipina IgG positivo (p < 0,005). La presencia de ACA IgG se relacionó de forma significativa con la existencia de hipertensión portal, de disfunción hepática y antecedentes de descompensación. En 10 de 23 pacientes (43,5 por ciento; IC del 95 por ciento: 23,2-65,5) con ACA positivo se detectaron anticuerpos anti-ß2 glucoproteína I. Conclusiones: La cuarta parte de los pacientes con hepatitis crónica por VHC presentan anticuerpos antifosfolipídicos. Estos anticuerpos podrían estar implicados en la progresión de la enfermedad. (AU)