Pesquisa | Secretaria de Estado da Saúde

1.

Emergence of Dengue Virus Serotype 2 Cosmopolitan Genotype, Brazil.

Giovanetti, Marta; Pereira, Luiz Augusto; Santiago, Gilberto A; Fonseca, Vagner; Mendoza, Maria Paquita García; de Oliveira, Carla; de Moraes, Laise; Xavier, Joilson; Tosta, Stephane; Fristch, Hegger; de Castro Barbosa, Emerson; Rodrigues, Evandra Strazza; Figueroa-Romero, Dana; Padilla-Rojas, Carlos; Cáceres-Rey, Omar; Mendonça, Ana Flávia; de Bruycker Nogueira, Fernanda; Venancio da Cunha, Rivaldo; de Filippis, Ana Maria Bispo; Freitas, Carla; Peterka, Cassio Roberto Leonel; de Albuquerque, Carlos Frederico Campelo; Franco, Leticia; Méndez Rico, Jairo Andrés; Muñoz-Jordán, Jorge L; Lemes da Silva, Vinícius; Alcantara, Luiz Carlos Junior.

Emerg Infect Dis ; 28(8): 1725-1727, 2022 08.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35876608

2.

Betacoronaviruses genome analysis reveals evolution toward specific codons usage: Implications for SARS-CoV-2 mitigation strategies.

Lopes, Elisson N; Fonseca, Vagner; Frias, Diego; Tosta, Stephane; Salgado, Álvaro; Assunção Vialle, Ricardo; Paulo Eduardo, Toscano S; Barreto, Fernanda K; Ariston de Azevedo, Vasco; Guarino, Michele; Angeletti, Silvia; Ciccozzi, Massimo; Junior Alcantara, Luiz C; Giovanetti, Marta.

J Med Virol ; 93(9): 5630-5634, 2021 09.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33934387

3.

Genomic surveillance activities unveil the introduction of the SARS-CoV-2 B.1.525 variant of interest in Brazil: Case report.

Pereira, Felicidade; Tosta, Stephane; Lima, Maricélia M; Reboredo de Oliveira da Silva, Luciana; Nardy, Vanessa B; Gómez, Marcela K A; Lima, Jaqueline G; Fonseca, Vagner; de Oliveira, Tulio; Lourenço, Jose; Alcantara, Luiz C; Giovanetti, Marta; Leal, Arabela.

J Med Virol ; 93(9): 5523-5526, 2021 09.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33990970

4.

Global SARS-CoV-2 genomic surveillance: What we have learned (so far).

Tosta, Stephane; Moreno, Keldenn; Schuab, Gabriel; Fonseca, Vagner; Segovia, Fátima María Cardozo; Kashima, Simone; Elias, Maria Carolina; Sampaio, Sandra Coccuzzo; Ciccozzi, Massimo; Alcantara, Luiz Carlos Junior; Slavov, Svetoslav Nanev; Lourenço, José; Cella, Eleonora; Giovanetti, Marta.

Infect Genet Evol ; 108: 105405, 2023 03.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36681102

5.

Phylogenetic Reconstructions Reveal the Circulation of a Novel Dengue Virus-1V Clade and the Persistence of a Dengue Virus-2 III Genotype in Northeast Brazil.

Fritsch, Hegger; Moreno, Keldenn; Lima, Italo Andrade Barbosa; Santos, Cleiton Silva; Costa, Bernardo Gratival Gouvea; de Almeida, Breno Lima; Dos Santos, Ronald Alves; Francisco, Marcos Vinicius Lima de Oliveira; Sampaio, Maria Paula Souza; de Lima, Maricelia Maia; Pereira, Felicidade Mota; Fonseca, Vagner; Tosta, Stephane; Xavier, Joilson; de Oliveira, Carla; Adelino, Talita; de Mello, Arabela Leal E Silva; Gräf, Tiago; Alcantara, Luiz Carlos Junior; Giovanetti, Marta; de Siqueira, Isadora Cristina.

Viruses ; 15(5)2023 04 28.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37243159

6.

Increased interregional virus exchange and nucleotide diversity outline the expansion of the chikungunya virus ECSA lineage in Brazil.

Xavier, Joilson; Alcantara, Luiz; Fonseca, Vagner; Lima, Mauricio; Castro, Emerson; Fritsch, Hegger; Oliveira, Carla; Guimarães, Natalia; Adelino, Talita; Evaristo, Mariane; Rodrigues, Evandra S; Santos, Elaine Vieira; de La-Roque, Debora; de Moraes, Laise; Tosta, Stephane; Neto, Adelino; Rosewell, Alexander; Mendonça, Ana Flavia; Leite, Anderson; Vasconcelos, Andreza; Silva de Mello, Arabela L; Vasconcelos, Bergson; Montalbano, Camila A; Zanluca, Camila; Freitas, Carla; de Albuquerque, Carlos F C; Duarte Dos Santos, Claudia Nunes; Santos, Cleiton S; Dos Santos, Cliomar Alves; Maymone Gonçalves, Crhistinne C; Teixeira, Dalane; Neto, Daniel F L; Cabral, Diego; de Oliveira, Elaine C; Noia Maciel, Ethel L; Pereira, Felicidade Mota; Iani, Felipe; de Carvalho, Fernanda P; Andrade, Gabriela; Bezerra, Gabriela; de Castro Lichs, Gislene G; Pereira, Glauco Carvalho; Barroso, Haline; Ferreira Franz, Helena Cristina; Ferreira, Hivylla; Gomes, Iago; Riediger, Irina N; Rodrigues, Isabela; de Siqueira, Isadora C; Silva, Jacilane.

medRxiv ; 2023 Apr 03.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37034611

7.

Increased interregional virus exchange and nucleotide diversity outline the expansion of chikungunya virus in Brazil.

Xavier, Joilson; Alcantara, Luiz Carlos Junior; Fonseca, Vagner; Lima, Mauricio; Castro, Emerson; Fritsch, Hegger; Oliveira, Carla; Guimarães, Natalia; Adelino, Talita; Evaristo, Mariane; Rodrigues, Evandra S; Santos, Elaine Vieira; de La-Roque, Debora; de Moraes, Laise; Tosta, Stephane; Neto, Adelino; Rosewell, Alexander; Mendonça, Ana Flavia; Leite, Anderson; Vasconcelos, Andreza; Silva de Mello, Arabela L; Vasconcelos, Bergson; Montalbano, Camila A; Zanluca, Camila; Freitas, Carla; de Albuquerque, Carlos F C; Duarte Dos Santos, Claudia Nunes; Santos, Cleiton S; Dos Santos, Cliomar Alves; Gonçalves, Crhistinne C Maymone; Teixeira, Dalane; Neto, Daniel F L; Cabral, Diego; de Oliveira, Elaine C; Noia Maciel, Ethel L; Pereira, Felicidade Mota; Iani, Felipe; de Carvalho, Fernanda P; Andrade, Gabriela; Bezerra, Gabriela; de Castro Lichs, Gislene G; Pereira, Glauco Carvalho; Barroso, Haline; Franz, Helena Cristina Ferreira; Ferreira, Hivylla; Gomes, Iago; Riediger, Irina N; Rodrigues, Isabela; de Siqueira, Isadora C; Silva, Jacilane.

Nat Commun ; 14(1): 4413, 2023 07 21.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37479700

8.

Machine learning models exploring characteristic single-nucleotide signatures in yellow fever virus.

Salgado, Álvaro; Melo-Minardi, Raquel C de; Giovanetti, Marta; Veloso, Adriano; Morais-Rodrigues, Francielly; Adelino, Talita; de Jesus, Ronaldo; Tosta, Stephane; Azevedo, Vasco; Lourenco, José; Alcantara, Luiz Carlos J.

PLoS One ; 17(12): e0278982, 2022.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36508435

9.

SARS-CoV-2 epidemic in Brazil: how the displacement of variants has driven distinct epidemic waves.

Alcantara, Luiz Carlos Junior; Nogueira, Elisson; Shuab, Gabriel; Tosta, Stephane; Fristch, Hegger; Pimentel, Victor; Souza-Neto, Jayme A; Coutinho, Luiz Lehmann; Fukumasu, Heidge; Sampaio, Sandra Coccuzzo; Elias, Maria Carolina; Kashima, Simone; Slavov, Svetoslav Nanev; Ciccozzi, Massimo; Cella, Eleonora; Lourenco, José; Fonseca, Vagner; Giovanetti, Marta.

Virus Res ; 315: 198785, 2022 07 02.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35461905

10.

Correction: Short Report: Early genomic detection of SARS-CoV-2 P.1 variant in Northeast Brazil.

Tosta, Stephane; Giovanetti, Marta; Brandão Nardy, Vanessa; Reboredo de Oliveira da Silva, Luciana; Kelly Astete Gómez, Marcela; Gomes Lima, Jaqueline; Wanderley Cardoso, Cristiane; Oliveira Silva, Tarcisio; São Pedro Leal de Souza, Marcia; Presta Dias, Pedro Henrique; Fonseca, Vagner; de Oliveira, Tulio; Lourenço, José; Carlos Junior Alcantara, Luiz; Pereira, Felicidade; Leal, Arabela.

PLoS Negl Trop Dis ; 16(12): e0011024, 2022 Dec.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36584006

11.

Retrospective Investigation in Horses with Encephalitis Reveals Unnoticed Circulation of West Nile Virus in Brazil.

Fritsch, Hegger; Pereira, Felicidade Mota; Costa, Erica Azevedo; Fonseca, Vagner; Tosta, Stephane; Xavier, Joilson; Levy, Flavia; Oliveira, Carla de; Menezes, Gabriela; Lima, Jaqueline; Santos, Lenisa; Silva, Luciana; Nardy, Vanessa; Astete, Marcela Kelly Gómez; Santos, Beatriz Senra Álvares da Silva; Aguiar, Nágila Rocha; Guedes, Maria Isabel Maldonado Coelho; Faria, Guilherme Canhestro de; Furtini, Ronaldo; Drumond, Safira Rachel Milanez; Cunha, Gabriel Muricy; Souza, Marcia São Pedro Leal; Jesus, Ronaldo de; Guimarães, Sara A Franco; Nuno, Italo Coelho; Santana, Ian Carlos Brito de; Sá, José Eduardo Ungar de; Santos, George Roma; Silva, Willadesmon Santos; Guedes, Thiago Ferreira; Araújo, Emerson Luiz Lima; Said, Rodrigo Fabiano do Carmo; Albuquerque, Carlos Frederico Campelo de; Peterka, Cassio Roberto Leonel; Romano, Alessandro Pecego Martins; Cunha, Rivaldo Venâncio da; Filippis, Ana Maria Bispo de; Leal E Silva de Mello, Arabela; Giovanetti, Marta; Alcantara, Luiz Carlos Junior.

Viruses ; 14(7)2022 07 14.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35891521

12.

Dynamics and Determinants of SARS-CoV-2 RT-PCR Testing on Symptomatic Individuals Attending Healthcare Centers during 2020 in Bahia, Brazil.

Pereira, Felicidade Mota; Salomão de Araujo, Aline; Catarina Martins Reis, Ana; Santos da Hora, Anadilton; Pinotti, Francesco; Paton, Robert S; Vilas Boas Figueiredo, Camylla; Lopes Damasceno, Caroline; Carlos Dos Santos, Daiana; Souza de Santana, Daniele; Freitas Sales, Danielle; Ariana Andrade Brandão, Evelyn; da Silva Batista, Everton; Campos de Sousa, Fulvia Soares; Santana Menezes, Gabriela; Silveira Dos Santos, Jackeline; Gomes Lima, Jaqueline; Tadeu Brito, Jean; Dandara Dos Santos, Lenisa; Reboredo, Luciana; Santana Santos, Maiara; Kelly Astete Gomez, Marcela; Freitas da Cruz, Marcia; Rosa Ampuero, Mariana; Guerra Lemos da Silva, Mariele; S da Paixão Melo, Mariza; Ferreira da Silva, Marta; de Jesus Gonçalves Dos Santos, Nadja; de Souza Pessoa, Núbia; Silva de Araujo, Ramile; de Macedo Godim, Taiane; Fraga de Oliveira Tosta, Stephane; Brandão Nardy, Vanessa; Cristina Faria, Elaine; Frederico de Carvalho Dominguez Souza, Breno; Laís Almeida Dos Santos, Jessica; Wikramaratna, Paul; Giovanetti, Marta; Alcântara, Luiz Carlos Junior; Lourenço, José; Leal E Silva de Mello, Arabela.

Viruses ; 14(7)2022 07 15.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35891528

13.

Genomic epidemiology of the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil.

Giovanetti, Marta; Slavov, Svetoslav Nanev; Fonseca, Vagner; Wilkinson, Eduan; Tegally, Houriiyah; Patané, José Salvatore Leister; Viala, Vincent Louis; San, Emmanuel James; Rodrigues, Evandra Strazza; Santos, Elaine Vieira; Aburjaile, Flavia; Xavier, Joilson; Fritsch, Hegger; Adelino, Talita Emile Ribeiro; Pereira, Felicidade; Leal, Arabela; Iani, Felipe Campos de Melo; de Carvalho Pereira, Glauco; Vazquez, Cynthia; Sanabria, Gladys Mercedes Estigarribia; Oliveira, Elaine Cristina de; Demarchi, Luiz; Croda, Julio; Dos Santos Bezerra, Rafael; Paola Oliveira de Lima, Loyze; Martins, Antonio Jorge; Renata Dos Santos Barros, Claudia; Marqueze, Elaine Cristina; de Souza Todao Bernardino, Jardelina; Moretti, Debora Botequio; Brassaloti, Ricardo Augusto; de Lello Rocha Campos Cassano, Raquel; Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa; Kitajima, João Paulo; Santos, Bibiana; Proto-Siqueira, Rodrigo; Cantarelli, Vlademir Vicente; Tosta, Stephane; Nardy, Vanessa Brandão; Reboredo de Oliveira da Silva, Luciana; Gómez, Marcela Kelly Astete; Lima, Jaqueline Gomes; Ribeiro, Adriana Aparecida; Guimarães, Natália Rocha; Watanabe, Luiz Takao; Barbosa Da Silva, Luana; da Silva Ferreira, Raquel; da Penha, Mara Patricia F; Ortega, María José; de la Fuente, Andrea Gómez.

Nat Microbiol ; 7(9): 1490-1500, 2022 09.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35982313

14.

Genomic epidemiology reveals the impact of national and international restrictions measures on the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil.

Giovanetti, Marta; Slavov, Svetoslav Nanev; Fonseca, Vagner; Wilkinson, Eduan; Tegally, Houriiyah; Patané, José Salvatore Leister; Viala, Vincent Louis; San, James Emmanuel; Rodrigues, Evandra Strazza; Santos, Elaine Vieira; Aburjaile, Flavia; Xavier, Joilson; Fritsch, Hegger; Adelino, Talita Emile Ribeiro; Pereira, Felicidade; Leal, Arabela; de Melo Iani, Felipe Campos; de Carvalho Pereira, Glauco; Vazquez, Cynthia; Mercedes Estigarribia Sanabria, Gladys; de Oliveira, Elaine Cristina; Demarchi, Luiz; Croda, Julio; Dos Santos Bezerra, Rafael; de Lima, Loyze Paola Oliveira; Martins, Antonio Jorge; Dos Santos Barros, Claudia Renata; Marqueze, Elaine Cristina; de Souza Todao Bernardino, Jardelina; Moretti, Debora Botequio; Brassaloti, Ricardo Augusto; de Lello Rocha Campos Cassano, Raquel; Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa; Kitajima, João Paulo; Santos, Bibiana; Proto-Siqueira, Rodrigo; Cantarelli, Vlademir Vicente; Tosta, Stephane; Nardy, Vanessa Brandão; de Oliveira da Silva, Luciana Reboredo; Kelly Astete Gómez, Marcela; Lima, Jaqueline Gomes; Ribeiro, Adriana Aparecida; Guimarães, Natália Rocha; Watanabe, Luiz Takao; Da Silva, Luana Barbosa; da Silva Ferreira, Raquel; da Penha, Mara Patricia F; Ortega, María José; de la Fuente, Andrea Gómez.

medRxiv ; 2022 Mar 28.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35378755

15.

Multi-epitope based vaccine against yellow fever virus applying immunoinformatics approaches.

Tosta, Stephane Fraga de Oliveira; Passos, Mariana Santana; Kato, Rodrigo; Salgado, Álvaro; Xavier, Joilson; Jaiswal, Arun Kumar; Soares, Siomar C; Azevedo, Vasco; Giovanetti, Marta; Tiwari, Sandeep; Alcantara, Luiz Carlos Junior.

J Biomol Struct Dyn ; 39(1): 219-235, 2021 Jan.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31854239

16.

Short Report: Early genomic detection of SARS-CoV-2 P.1 variant in Northeast Brazil.

Tosta, Stephane; Giovanetti, Marta; Brandão Nardy, Vanessa; Reboredo de Oliveira da Silva, Luciana; Kelly Astete Gómez, Marcela; Gomes Lima, Jaqueline; Wanderley Cardoso, Cristiane; Oliveira Silva, Tarcisio; São Pedro Leal de Souza, Marcia; Presta Dias, Pedro Henrique; Fonseca, Vagner; de Oliveira, Tulio; Lourenço, José; Carlos Junior Alcantara, Luiz; Pereira, Felicidade; Leal, Arabela.

PLoS Negl Trop Dis ; 15(7): e0009591, 2021 07.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34280196

17.

Chikungunya virus ECSA lineage reintroduction in the northeasternmost region of Brazil.

Xavier, Joilson; Fonseca, Vagner; Bezerra, Joao Felipe; do Monte Alves, Manoella; Mares-Guia, Maria Angélica; Claro, Ingra Morales; de Jesus, Ronaldo; Adelino, Talita; Araújo, Emerson; Cavalcante, Karina Ribeiro Leite Jardim; Tosta, Stephane; de Souza, Themis Rocha; Moreira da Cruz, Flavia Emanuelle; de Araújo Fabri, Allison; de Oliveira, Elaine Cristina; de Moura, Noely Fabiana Oliveira; do Carmo Said, Rodrigo Fabiano; de Albuquerque, Carlos Frederico Campelo; Azevedo, Vasco; de Oliveira, Tulio; de Filippis, Ana Maria Bispo; Venâncio da Cunha, Rivaldo; Luz, Kleber Giovanni; Giovanetti, Marta; Alcantara, Luiz Carlos Junior.

Int J Infect Dis ; 105: 120-123, 2021 Apr.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33476757

18.

Field and classroom initiatives for portable sequence-based monitoring of dengue virus in Brazil.

Adelino, Talita Émile Ribeiro; Giovanetti, Marta; Fonseca, Vagner; Xavier, Joilson; de Abreu, Álvaro Salgado; do Nascimento, Valdinete Alves; Demarchi, Luiz Henrique Ferraz; Oliveira, Marluce Aparecida Assunção; da Silva, Vinícius Lemes; de Mello, Arabela Leal E Silva; Cunha, Gabriel Muricy; Santos, Roselene Hans; de Oliveira, Elaine Cristina; Júnior, Jorge Antônio Chamon; de Melo Iani, Felipe Campos; de Filippis, Ana Maria Bispo; de Abreu, André Luiz; de Jesus, Ronaldo; de Albuquerque, Carlos Frederico Campelo; Rico, Jairo Mendez; do Carmo Said, Rodrigo Fabiano; Silva, Joscélio Aguiar; de Moura, Noely Fabiana Oliveira; Leite, Priscila; Frutuoso, Lívia Carla Vinhal; Haddad, Simone Kashima; Martínez, Alexander; Barreto, Fernanda Khouri; Vazquez, Cynthia Carolina; da Cunha, Rivaldo Venâncio; Araújo, Emerson Luiz Lima; de Oliveira Tosta, Stephane Fraga; de Araújo Fabri, Allison; Chalhoub, Flávia Löwen Levy; da Silva Lemos, Poliana; de Bruycker-Nogueira, Fernanda; de Castro Lichs, Gislene Garcia; Zardin, Marina Castilhos Souza Umaki; Segovia, Fátima María Cardozo; Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone; Grillo, Zoraida Del Carmen Fernandez; Slavov, Svetoslav Nanev; Pereira, Luiz Augusto; Mendonça, Ana Flávia; Pereira, Felicidade Mota; de Magalhães, Jurandy Júnior Ferraz; Dos Santos Júnior, Agenor de Castro Moreira; de Lima, Maricélia Maia; Nogueira, Rita Maria Ribeiro; Góes-Neto, Aristóteles.

Nat Commun ; 12(1): 2296, 2021 04 16.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33863880

19.

Persistence of chikungunya ECSA genotype and local outbreak in an upper medium class neighborhood in Northeast Brazil.

Goes de Jesus, Jaqueline; da Luz Wallau, Gabriel; Lima Maia, Maricelia; Xavier, Joilson; Oliveira Lima, Maria Aparecida; Fonseca, Vagner; Salgado de Abreu, Alvaro; Fraga de Oliveira Tosta, Stephane; Ramos do Amaral, Helineide; Andrade Barbosa Lima, Italo; Viana Silva, Paloma; Carlos Dos Santos, Daiana; Sousa de Oliveira, Aline; Campos de Souza, Siane; Barreto Falcão, Melissa; Cerqueira, Erenilde; Ceschini Machado, Laís; Sobral, Mariana Carolina; Teodoro Rezende, Tatiana Maria; Ribeiro Pereira, Mylena; Mota Pereira, Felicidade; Pereira Gusmão Maia, Zuinara; Freitas de Oliveira França, Rafael; Luiz de Abreu, André; Campelo de Albuquerque E Melo, Carlos Frederico; Rodrigues Faria, Nuno; Venâncio da Cunha, Rivaldo; Giovanetti, Marta; Alcantara, Luiz Carlos Junior.

PLoS One ; 15(1): e0226098, 2020.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31914137

20.

Circulation of chikungunya virus East/Central/South African lineage in Rio de Janeiro, Brazil.

Xavier, Joilson; Giovanetti, Marta; Fonseca, Vagner; Thézé, Julien; Gräf, Tiago; Fabri, Allison; Goes de Jesus, Jaqueline; Lima de Mendonça, Marcos Cesar; Damasceno Dos Santos Rodrigues, Cintia; Mares-Guia, Maria Angélica; Cardoso Dos Santos, Carolina; Fraga de Oliveira Tosta, Stephane; Candido, Darlan; Ribeiro Nogueira, Rita Maria; Luiz de Abreu, André; Kleber Oliveira, Wanderson; Campelo de Albuquerque, Carlos F; Chieppe, Alexandre; de Oliveira, Tulio; Brasil, Patrícia; Calvet, Guilherme; Carvalho Sequeira, Patrícia; Rodrigues Faria, Nuno; Bispo de Filippis, Ana Maria; Alcantara, Luiz Carlos Junior.

PLoS One ; 14(6): e0217871, 2019.

Artigo Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31185030

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