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1.
J Mol Biol ; 366(2): 461-8, 2007 Feb 16.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-17174333

RESUMO

Outer membrane phospholipase A (OMPLA) is a unique, integral membrane enzyme found in Gram-negative bacteria and is an important virulence factor for pathogens such as Helicobacter pylori. This broad-specificity lipase degrades a variety of lipid substrates, and it plays a direct role in adjusting the composition and permeability of bacterial membranes under conditions of stress. Interestingly, OMPLA shows little preference for the lipid headgroup and, instead, the length of the hydrophobic acyl chain is the strongest determinant for substrate selection by OMPLA, with the enzyme strongly preferring substrates with chains equal to or longer than 14 carbon atoms. The question remains as to how a hydrophobic protein like OMPLA can achieve this specificity, particularly when the shorter chains can be accommodated in the binding pocket. Using a series of sulfonyl fluoride inhibitors with various lengths of acyl chain, we show here that the thermodynamics of substrate-induced OMPLA dimerization are guided by the acyl chain length, demonstrating that OMPLA uses a unique biophysical mechanism to select its phospholipid substrate.


Assuntos
Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/metabolismo , Fosfolipases A/metabolismo , Ácidos Sulfínicos/farmacologia , Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/antagonistas & inibidores , Sítios de Ligação , Catálise , Ativação Enzimática , Interações Hidrofóbicas e Hidrofílicas , Lipídeos , Estrutura Molecular , Fosfolipases A/antagonistas & inibidores , Fosfolipases A1 , Estrutura Quaternária de Proteína , Estrutura Terciária de Proteína , Relação Estrutura-Atividade , Especificidade por Substrato , Ácidos Sulfínicos/química
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