Toward a generalizable machine learning workflow for neurodegenerative disease staging with focus on neurofibrillary tangles.

Machine learning (ML) has increasingly been used to assist and expand current practices in neuropathology. However, generating large imaging datasets with quality labels is challenging in fields which demand high levels of expertise. Further complicating matters is the often seen disagreement between experts in neuropathology-related tasks, both at the case level and at a more granular level. Neurofibrillary tangles (NFTs) are a hallmark pathological feature of Alzheimer disease, and are associated with disease progression which warrants further investigation and granular quantification at a scale not currently accessible in routine human assessment. In this work, we first provide a baseline of annotator/rater agreement for the tasks of Braak NFT staging between experts and NFT detection using both experts and novices in neuropathology. We use a whole-slide-image (WSI) cohort of neuropathology cases from Emory University Hospital immunohistochemically stained for Tau. We develop a workflow for gathering annotations of the early stage formation of NFTs (Pre-NFTs) and mature intracellular (iNFTs) and show ML models can be trained to learn annotator nuances for the task of NFT detection in WSIs. We utilize a model-assisted-labeling approach and demonstrate ML models can be used to aid in labeling large datasets efficiently. We also show these models can be used to extract case-level features, which predict Braak NFT stages comparable to expert human raters, and do so at scale. This study provides a generalizable workflow for various pathology and related fields, and also provides a technique for accomplishing a high-level neuropathology task with limited human annotations.

Bioseguridad durante el Internado de Medicina en Hospitales de Trujillo ûLa Libertad 2010: a propósito de la muerte de un estudiante de medicina / Biosecurity for the boarding of Medicine Hospital from Trujillo - La Libertad 2010: report of the death of a medical students

Objetivo: Conocer las características de bioseguridad en el internado de Medicina de Trujillo û La Libertad, 2010. Material y método: Se realizó un estudio descriptivo, transversal, en una muestra de 80 internos de medicina de Hospitales de Trujillo - La Libertad durante los meses de julio û agosto 2010, utilizando como instrumento la encuesta del estudio Características del Internado de Medicina en el Perú, 2010. Se realizó estadística descriptiva con frecuencias absolutas y relativas. Resultados: Se encuestó a 80 internos de medicina, sexo masculino (61,2 %) y femenino (38,8%), con edad entre 23 y 27 años. El 40% recibió capacitación en bioseguridad, brindada en un 32,5% por la sede hospitalaria y 7,5% por la universidad, ninguno había recibido material de protección personal al momento del cuestionario, y 13,7% mencionan contar con un seguro contra accidentes laborales. Conclusiones: Los Internos de medicina de los hospitales de la Libertad û Trujillo en su mayoría no cuentan con capacitación oportuna en bioseguridad, ni se les entrega materiales para su protección personal en sus prácticas hospitalarias, considerando además que la gran mayoría están desprovistos de un seguro de protección contra accidentes laborales.

Objectives: To know the features of medicine internship in the main hospitals directed by the Ministry of Health (MINSA) and Peruvian Social Security (EsSalud) in La Libertad, Trujillo. Material and Method: Descriptive, analytical, and cross-sectional study. Results: Eighty medicine interns were interviewed, 61,2% (49) were male and 38.8 (31) were female, and their ages were between 23 and 27 years. Forty percent had training about biosafety; however, none received any technical documents regarding this topic. Some interns declared they had an insurance policy for working place-related accidents and adequate places for rest (13,7% and 17,5%, respectively). Conclusion: Interns lack appropriate and timely training in biosafety issues, and these persons are exposed to a great deal of risk during their last year of medical training in the hospital, and the great majority of them do not have any insurance policy that may protect them from working place-related accidents.

Actualización para el médico no especialista en el tratamiento del VIH / Update for the General Physician in the treatment of the HIV

Despues de dos décadas de disponibilidad de medicamentos antiretrovirales el pronóstico de los pacientes infectados con el virus de la immunodeficiencias adquirida (VIH) ha cambiado dramáticamente. El curso de esta infección ha pasado de ser una infección casi indefectiblemente fatal a una infección crónica con una esperanza de vida potencial casi normal. Eso se ha traducido en dramáticas reducciones en la tasas de mortalidad en países donde existe amplia disponibilidad a estos medicamentos. Con tasas de incidencias relativamente estables o en aumento y disminución de la mortalidad, la prevalenica de esta infección continua aumentando. Eso hace cada vez más probable que el médico no especialista encuentre en su práctica pacientes infectados con VIH. Es por eso que esta revisión esta dirijida principalmente al médico no especialista y tiene como objetivo su actualización dada la creciente complejidad del tratamiento de esta infección. Esta es una revisión superficial pero amplia del estado actual del tratamiento de la infección por el VIH, e incluye los esquemas principales, alternativos y una descripción de las dos nuevas clases de medicamentos recientemente disponibles.

After two decades of availability of antiretroviral therapy, the prognosis of HIV-infected patients has changed dramatically. The curse of this infection has changed from a rapidly fatal infection to a more manageable, chronic infection with an almost normal life span. This has led to a dramatic reduction in the mortality rate related to HIV in countries where antiretroviral therapy is widely available. With incidence rates stable or increasing and lower mortality, the prevalence of this infection is increasing. This fact increases the chances of non-specialist physicians to encounter HIV infected patients in their practice. That is why this revision is directed to the non-specialist physician and its objective is to update their knowledge in the complex area of the management of HIV therapy. This is a broad but superficial revision of the current status of the management of HIV infection therapy, and includes the use of first line and alternative options of therapy as well as the description of two newly approved classes of antiretrovirals.

Condiciones de vida de personas que viven con el virus del SIDA. Investigación cualitativa en un grupo de ayuda mutua de Lima / Conditions of life of people who live with the viruses of AIDS. Qualitative investigation in a group of mutual aid of Lima

Se buscó identificar las condiciones de vida del primer grupo de ayuda mutua (GAM) formado por personas con el virus de inmunodeficiencia humana (VIH) en Lima, Perú. La investigación se realizó en ambientes de la Parroquia "La Recoleta", Plaza Francia, entre marzo de 1997 y febrero de 1998. La muestra estuvo conformada por 20 personas contagiados por vía sexual, la mayoría con comportamiento homosexual o bisexual. Los casos se encontraban en diversos estadios de la infección, incluyendo el SIDA. La mayoría hacía lecturas relativas a su enfermedad; un pequeño número estudiaba y algunos tenían interés en escribir y aprender en los tallares del GAM. Hubo algunos cuadros depresivos al momento del diagnóstico, conforme pasó el tiempo, se sentían mejor. Sus relaciones sexuales disminuyeron en número después del diagnóstico, aunque en otros casos aumentaron hasta llegar a la promiscuidad. Las preferencias homosexuales/bisexuales se mantenían en "secreto", particularmente entre los vecinos y el trabajo. Son pocos los que trabajan y perciben que la relación ha cambiado después de conocer el diagnóstico. En los estratos sociales menos favorecidos la familia les da apoyo y en los estratos mejores hay total rechazo hacia el seropositivo y sufren agresiones físicas. Vivían en casas con relativa comodidad; la aparente poca privacidad obligó a algunos a mudarse del núcleo familiar. Unos cuantos cambiaron su relación con sus creencias religiosas. El diagnóstico fue un motor de búsqueda de reflexión y prefirieron que sus amigos no se enteren de sus preferencias sexuales. Se puede colegir que las condiciones de vida de las personas que viven con el VIH que asisten al primer GAM constituido en Lima, en general, no corresponden a su expectativas.