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Nucleic Acids Res ; 48(21): 12282-12296, 2020 12 02.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33196848

RESUMO

The superfamily 2 helicase XPB is an integral part of the general transcription factor TFIIH and assumes essential catalytic functions in transcription initiation and nucleotide excision repair. The ATPase activity of XPB is required in both processes. We investigated the interaction network that regulates XPB via the p52 and p8 subunits with functional mutagenesis based on our crystal structure of the p52/p8 complex and current cryo-EM structures. Importantly, we show that XPB's ATPase can be activated either by DNA or by the interaction with the p52/p8 proteins. Intriguingly, we observe that the ATPase activation by p52/p8 is significantly weaker than the activation by DNA and when both p52/p8 and DNA are present, p52/p8 dominates the maximum activation. We therefore define p52/p8 as the master regulator of XPB acting as an activator and speed limiter at the same time. A correlative analysis of the ATPase and translocase activities of XPB shows that XPB only acts as a translocase within the context of complete core TFIIH and that XPA increases the processivity of the translocase complex without altering XPB's ATPase activity. Our data define an intricate network that tightly controls the activity of XPB during transcription and nucleotide excision repair.


Assuntos
Adenosina Trifosfatases/química , Chaetomium/química , DNA/genética , Proteínas Fúngicas/química , Subunidades Proteicas/química , Fator de Transcrição TFIIH/química , Adenosina Trifosfatases/genética , Adenosina Trifosfatases/metabolismo , Sítios de Ligação , Chaetomium/genética , Chaetomium/metabolismo , Clonagem Molecular , Cristalografia por Raios X , DNA/metabolismo , DNA Helicases/química , DNA Helicases/genética , DNA Helicases/metabolismo , Reparo do DNA , Proteínas de Ligação a DNA/química , Proteínas de Ligação a DNA/genética , Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/metabolismo , Proteínas Fúngicas/genética , Proteínas Fúngicas/metabolismo , Expressão Gênica , Vetores Genéticos/química , Vetores Genéticos/metabolismo , Humanos , Cinética , Modelos Moleculares , Ligação Proteica , Conformação Proteica em alfa-Hélice , Conformação Proteica em Folha beta , Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas , Subunidades Proteicas/genética , Subunidades Proteicas/metabolismo , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Especificidade por Substrato , Fator de Transcrição TFIIH/genética , Fator de Transcrição TFIIH/metabolismo , Transcrição Gênica
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