Sugarcane genes related to mitochondrial function

RESUMO

A mitocôndria funciona como uma usina geradora metabólica por meio da fosforilaçäo oxidativa e tem sido alvo de um renovado interesse devido aos progressos no entendimento de sua biogênese e na descriçäo de novos papéis ligados à senescência, morte celular e montagem dos centros Fe/S. Uma análise global dos genes de planta ligados a esta organela é agora possível. A base de dados do projeto SUCEST foi examinada para detecçäo de ESTs com similaridade a genes nucleares relacionados às funções mitocondriais usando-se proteínas de Saccharomyces cerevisiae, Homo sapiens e Arabidopsis thaliana. Foram utilizadas 869 seqüências de proteínas para varrer o banco de ESTs do projeto SUCEST por meio do programa de busca de similaridade TBLASTN, sendo examinados 81.223 agrupamentos. Encontramos 367 agrupamentos com E-value>10-10 que representam os prováveis ortólogos em cana-de-açúcar dos genes correspondentes humanos, de levedura e de Arabidopsis. Encontramos produtos gênicos relacionados a todas as categorias funcionais ligados à atividade mitocondrial de maneira que este estudo serve de ponto de partida para a identificaçäo dos genes de cana-de-açúcar envolvidos na biogênese e funçäo da organela e para o estudo da estrutura e fisiologia destes genes.