Your browser doesn't support javascript.
loading
Draft genome sequence of Streptomyces sp. strain F1, a potential source for glycoside hydrolases isolated from Brazilian soil.
Melo, Ricardo Rodrigues de; Persinoti, Gabriela Felix; Paixão, Douglas Antonio Alvaredo; Squina, Fábio Márcio; Ruller, Roberto; Sato, Helia Harumi.
  • Melo RR; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM), Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE), Campinas, São Paulo, Brazil; Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Faculdade de Engenharia de Alimentos, Departamento de Ciência de Alimentos, Campinas, São Paulo, Bra
  • Persinoti GF; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM), Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE), Campinas, São Paulo, Brazil.
  • Paixão DAA; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM), Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE), Campinas, São Paulo, Brazil.
  • Squina FM; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM), Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE), Campinas, São Paulo, Brazil.
  • Ruller R; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM), Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE), Campinas, São Paulo, Brazil. Electronic address: roberto.ruller@bioetanol.org.br.
  • Sato HH; Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Faculdade de Engenharia de Alimentos, Departamento de Ciência de Alimentos, Campinas, São Paulo, Brazil. Electronic address: heliah@fea.unicamp.br.
Braz J Microbiol ; 48(4): 612-614, 2017.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28359855
ABSTRACT
Here, we show the draft genome sequence of Streptomyces sp. F1, a strain isolated from soil with great potential for secretion of hydrolytic enzymes used to deconstruct cellulosic biomass. The draft genome assembly of Streptomyces sp. strain F1 has 69 contigs with a total genome size of 8,142,296bp and G+C 72.65%. Preliminary genome analysis identified 175 proteins as Carbohydrate-Active Enzymes, being 85 glycoside hydrolases organized in 33 distinct families. This draft genome information provides new insights on the key genes encoding hydrolytic enzymes involved in biomass deconstruction employed by soil bacteria.
Asunto(s)
Palabras clave

Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Microbiología del Suelo / Streptomyces / Proteínas Bacterianas / Genoma Bacteriano / Glicósido Hidrolasas País como asunto: America do sul / Brasil Idioma: En Año: 2017 Tipo del documento: Article

Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Microbiología del Suelo / Streptomyces / Proteínas Bacterianas / Genoma Bacteriano / Glicósido Hidrolasas País como asunto: America do sul / Brasil Idioma: En Año: 2017 Tipo del documento: Article