Detecting Differential Transcription Factor Activity from ATAC-Seq Data.

Tripodi, Ignacio J; Allen, Mary A; Dowell, Robin D

Tripodi, Ignacio J; Allen, Mary A; Dowell, Robin D.

Tripodi IJ; Computer Science, University of Colorado, Boulder, CO 80305, USA. ignacio.tripodi@colorado.edu.
Allen MA; BioFrontiers Institute, University of Colorado, Boulder, CO 80303, USA. ignacio.tripodi@colorado.edu.
Dowell RD; BioFrontiers Institute, University of Colorado, Boulder, CO 80303, USA. mary.a.allen@colorado.edu.

Molecules ; 23(5)2018 May 10.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29748466

Asunto(s)

Análisis de Secuencia de ADN; Factores de Transcripción/metabolismo; Línea Celular Tumoral; Enfermedad/genética; Humanos; Mutación/genética; Motivos de Nucleótidos/genética

Palabras clave

ATAC-seq; DAStk; DNase I cleavage; RNA-seq; motif; open chromatin; perturbation; transcription factor

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Factores de Transcripción / Análisis de Secuencia de ADN Límite: Humans Idioma: En Año: 2018 Tipo del documento: Article

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