How to choose templates for modeling of protein complexes: Insights from benchmarking template-based docking.

Chakravarty, Devlina; McElfresh, G W; Kundrotas, Petras J; Vakser, Ilya A

Chakravarty, Devlina; McElfresh, G W; Kundrotas, Petras J; Vakser, Ilya A.

Chakravarty D; Computational Biology Program, The University of Kansas, Lawrence, Kansas.
McElfresh GW; Computational Biology Program, The University of Kansas, Lawrence, Kansas.
Kundrotas PJ; Computational Biology Program, The University of Kansas, Lawrence, Kansas.
Vakser IA; Computational Biology Program, The University of Kansas, Lawrence, Kansas.

Proteins ; 88(8): 1070-1081, 2020 08.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31994759

Asunto(s)

Simulación del Acoplamiento Molecular; Péptidos/química; Proteínas/química; Programas Informáticos; Secuencia de Aminoácidos; Animales; Benchmarking; Sitios de Unión; Perros; Escherichia coli/química; Humanos; Ligandos; Péptidos/metabolismo; Unión Proteica; Conformación Proteica en Hélice alfa; Conformación Proteica en Lámina beta; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; Mapeo de Interacción de Proteínas; Multimerización de Proteína; Proteínas/metabolismo; Proyectos de Investigación; Homología Estructural de Proteína; Termodinámica

Palabras clave

protein recognition; sequence homology; structure prediction; structure similarity; template detection

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Péptidos / Programas Informáticos / Proteínas / Simulación del Acoplamiento Molecular Tipo de estudio: Guideline / Prognostic_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Año: 2020 Tipo del documento: Article

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