CellRegMap: a statistical framework for mapping context-specific regulatory variants using scRNA-seq.

Cuomo, Anna S E; Heinen, Tobias; Vagiaki, Danai; Horta, Danilo; Marioni, John C; Stegle, Oliver

Cuomo, Anna S E; Heinen, Tobias; Vagiaki, Danai; Horta, Danilo; Marioni, John C; Stegle, Oliver.

Cuomo ASE; European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Cambridge, UK.
Heinen T; Wellcome Sanger Institute, Cambridge, UK.
Vagiaki D; Division of Computational Genomics and Systems Genetics, German Cancer Research Centre (DKFZ), Heidelberg, Germany.
Horta D; European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Genome Biology, Heidelberg, Germany.
Marioni JC; Faculty of Mathematics and Computer Science, Heidelberg University, Heidelberg, Germany.
Stegle O; Division of Computational Genomics and Systems Genetics, German Cancer Research Centre (DKFZ), Heidelberg, Germany.

Mol Syst Biol ; 18(8): e10663, 2022 08.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35972065

Asunto(s)

Regulación de la Expresión Génica; Análisis de la Célula Individual; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Humanos; RNA-Seq; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Análisis de la Célula Individual/métodos

Palabras clave

cell-type specificity; eQTL; genetic interaction; single-cell sequencing

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Regulación de la Expresión Génica / Análisis de la Célula Individual Límite: Humans Idioma: En Año: 2022 Tipo del documento: Article

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