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ShigaPass: an in silico tool predicting Shigella serotypes from whole-genome sequencing assemblies.
Yassine, Iman; Hansen, Elisabeth E; Lefèvre, Sophie; Ruckly, Corinne; Carle, Isabelle; Lejay-Collin, Monique; Fabre, Laetitia; Rafei, Rayane; Pardos de la Gandara, Maria; Daboussi, Fouad; Shahin, Ahmad; Weill, François-Xavier.
  • Yassine I; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Hansen EE; Laboratoire Microbiologie Santé et Environnement (LMSE), Doctoral School of Sciences and Technology, Faculty of Public Health, Lebanese University, Tripoli, Lebanon.
  • Lefèvre S; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Ruckly C; Present address: Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA.
  • Carle I; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Lejay-Collin M; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Fabre L; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Rafei R; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Pardos de la Gandara M; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Daboussi F; Laboratoire Microbiologie Santé et Environnement (LMSE), Doctoral School of Sciences and Technology, Faculty of Public Health, Lebanese University, Tripoli, Lebanon.
  • Shahin A; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Unité des Bactéries pathogènes entériques, Centre National de Référence des Escherichia coli, Shigella et Salmonella, Paris, F-75015, France.
  • Weill FX; Laboratoire Microbiologie Santé et Environnement (LMSE), Doctoral School of Sciences and Technology, Faculty of Public Health, Lebanese University, Tripoli, Lebanon.
Microb Genom ; 9(3)2023 03.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-36951906
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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Shigella / Antígenos O Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Año: 2023 Tipo del documento: Article
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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Shigella / Antígenos O Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Año: 2023 Tipo del documento: Article