TB drug susceptibility testing in high fluoroquinolone resistance settings.

ABSTRACT

BACKGROUND: The insurgence of resistance to key drugs of the BPaLM (bedaquiline + pretomanid + moxifloxacin) regimen is a major concern. In settings with widespread resistance to fluoroquinolones (FQs), like Pakistan, new technologies, such as Xpert® MTB/XDR, may ensure drug resistance upfront screening. This study aims to assess MTB/XDR's performance in detecting FQs and isoniazid resistance, proposing a renewed diagnostic algorithm for drug-resistant TB (DR-TB). METHODS: This cross-sectional prospective study, approved by the local ethical committee, collected samples from people newly and previously diagnosed with TB over 6 months. Xpert® MTB/RIF Ultra, MTB/XDR, Genotype® MTBDRplus, Genotype® MTBDRsl, culture, and phenotypic drug susceptibility testing (pDST) for relevant drugs (including bedaquiline and levofloxacin) were performed. Next-generation sequencing (NGS) resolved discordances between MTB/XDR and pDST results. RESULTS: The analysis showed that MTB/XDR has 91.5% and 88.2% sensitivity and 99.5% and 97.7% specificity in detecting respectively isoniazid (INH) and resistance to FQs, demonstrating that MTB/XDR meets the WHO targets for INH resistance detection at the peripheral level. NGS effectively resolved discordances between MTB/XDR and pDST results. CONCLUSIONS: The obtained results allowed designing the proposed diagnostic algorithm for rapid identification of DR-TB, ensuring rapid and equitable access to drug susceptibility testing for TB, ultimately improving TB care and control.

CONTEXTE La recrudescence de la résistance aux médicaments clés du régime BPaLM (bédaquiline + prétomanide + moxifloxacine) est une préoccupation majeure. Dans les contextes où la résistance aux fluoroquinolones (FQ) est répandue, comme le Pakistan, de nouvelles technologies, telles que Xpert® MTB/XDR, peuvent assurer un dépistage initial de la résistance aux médicaments. Cette étude vise à évaluer la performance de MTB/XDR dans la détection des FQ et de la résistance à l'isoniazide, en proposant un algorithme de diagnostic renouvelé pour la TB pharmacorésistante (DR-TB, pour l'anglais «drug-resistant TB ¼ ). MÉTHODES Cette étude prospective transversale, approuvée par le comité d'éthique local, a recueilli des échantillons de personnes nouvellement diagnostiquées et précédemment diagnostiquées avec la TB pendant 6 mois. Xpert® MTB/RIF Ultra, MTB/XDR, le GenoType® MTBDRplus, le GenoType® MTBDRsl, la culture et des tests phénotypiques de sensibilité aux médicaments (pDST, pour l'anglais «phenotypic drug susceptibility testing ¼ ) pour les médicaments pertinents (y compris la bédaquiline et la lévofloxacine) ont été effectués. Le séquençage de nouvelle génération (NGS, pour l'anglais «next-generation sequencing ¼ ) a résolu les discordances entre les résultats MTB/XDR et pDST. RÉSULTATS L'analyse a montré que le MTB/XDR a une sensibilité de 91,5% et 88,2% et une spécificité de 99,5% et 97,7% dans la détection respectivement de l'isoniazide et de la résistance aux FQ, démontrant que le MTB/XDR répond aux objectifs de l'OMS pour la détection de la résistance à l'isoniazide au niveau périphérique. NGS a efficacement résolu les discordances entre les résultats MTB/XDR et pDST. CONCLUSIONS: Les résultats obtenus ont permis de concevoir l'algorithme de diagnostic proposé pour l'identification rapide de la DR-TB, garantissant un accès rapide et équitable aux tests de sensibilité aux médicaments pour la TB, améliorant ainsi la prise en charge et le contrôle de la TB.