Reference genes for studies in infectious parasitic diseases in five types of human tissues
Meira-Strejevitch, Cristina Silva; Pereira-Chiocola, Vera Lucia; Maia, Marta Marques; Hippolito, Daise Damaris Carnietto de; Wang, Hui-Tzu Lin; Motoie, G; Gomes, Aparecida Helena de Souza; Kanamura, Cristina Takami; Martines, Roosecelis Brasil; Mattos, Cinara Cássia Brandão de; Frederico, F B; Mattos, L C de.
Gene reports
; 7: 98-105, 2017.
Artigo
Inglês
| LILACS, SES-SP, SES SP - Centro de Documentação/CCD, SES-SP, SES SP - Instituto Adolfo Lutz, SES-SP | ID: biblio-1049153
As análises de expressão gênica baseadas na expressão do RNA mensageiro (mRNA) requerem normalização precisa dos dados. Ao usar genes de referência endógenos, estes devem ser cuidadosamente validados. Os genes de referência validados variam muito, dependendo do tecido, subconjuntos de células e contexto experimental. Este estudo teve como objetivo identificar genes de referência que apresentam níveis de mRNA mais estáveis ââentre indivíduos em células mononucleares do sangue periférico (PBMC); biópsias de pele fresca; autópsias pulmonares e cerebrais, bem como biópsias de pele fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFPE). Portanto, 6 genes de referência endógenos foram avaliados por reação quantitativa em cadeia da polimerase em tempo real rRNA 18S, gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase (GAPDH), proteína de ligação à caixa TATA (TBP), beta-2-microbolina (B2M), ubiquitina C (UBC) e ATP sintase 6 mitocondrialmente codificada (MT-ATP6). Além disso, a validação de suas estabilidades e desempenho como genes de referência foi determinada pelos programas geNorm e NormFinder. Os resultados mostram que os genes mais estáveis ââpara PBMC e biópsias de pele fresca foram TBP e UBC; nas autópsias pulmonares de FFPE e biópsias de pele foram GAPDH e B2M; e nas autópsias cerebrais de FFPE foram GAPDH e UBC. Além disso, o 18S rRNA foi o menos estável de todos os genes analisados. Esses dados concluíram que mesmo os genes expressos constitutivamente apresentam variações no nível de transcrição em diferentes tecidos, bem como condições experimentais e de armazenamento. Essas observações sugerem que genes de referência adequados devem ser selecionados para normalização da análise dos dados de expressão gênica.
Biblioteca responsável:
BR91.2
Localização: BR91.2; P
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