The PDB-Preview database: a repository of in-silico models of 'on-hold' PDB entries.

Fischer, Daniel; Pas, Jakub; Rychlewski, Leszek

Fischer, Daniel; Pas, Jakub; Rychlewski, Leszek.

Afiliação

Fischer D; Buffalo Center of Excellence in Bioinformatics, University of Buffalo, 901 Washington Street Ste. 300, Buffalo, NY 14203, USA.

Bioinformatics ; 20(15): 2482-4, 2004 Oct 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-15073011

ABSTRACT

ABSTRACT

UNLABELLED The PDB-Preview database is a dynamic web repository of in-silico predicted three-dimensional (3D) models of experimentally determined structures that are deposited into the PDB but are not yet publicly released, and are kept 'on-hold'. The PDB-Preview database is automatically generated on a weekly basis by the bioinfo.pl meta-server, which uses top-of-the-line fold-recognition methods. The PDB-Preview provides biologists with preliminary fold assignments well before the experimentally determined 3D structures are released.

AVAILABILITY:

http//bioinfo.pl/PDB-Preview/.

Assuntos

Sistemas de Gerenciamento de Base de Dados; Bases de Dados de Proteínas; Armazenamento e Recuperação da Informação/métodos; Modelos Moleculares; Proteínas/química; Alinhamento de Sequência/métodos; Análise de Sequência de Proteína/métodos; Simulação por Computador; Disseminação de Informação/métodos; Internet; Conformação Proteica; Proteínas/classificação; Interface Usuário-Computador

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Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sistemas de Gerenciamento de Base de Dados / Proteínas / Modelos Moleculares / Armazenamento e Recuperação da Informação / Alinhamento de Sequência / Análise de Sequência de Proteína / Bases de Dados de Proteínas Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2004 Tipo de documento: Article

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