Identification of Pou5f1, Sox2, and Nanog downstream target genes with statistical confidence by applying a novel algorithm to time course microarray and genome-wide chromatin immunoprecipitation data.

Sharov, Alexei A; Masui, Shinji; Sharova, Lioudmila V; Piao, Yulan; Aiba, Kazuhiro; Matoba, Ryo; Xin, Li; Niwa, Hitoshi; Ko, Minoru S H

Sharov, Alexei A; Masui, Shinji; Sharova, Lioudmila V; Piao, Yulan; Aiba, Kazuhiro; Matoba, Ryo; Xin, Li; Niwa, Hitoshi; Ko, Minoru S H.

Afiliação

Sharov AA; Developmental Genomics and Aging Section, Laboratory of Genetics, National Institute on Aging, NIH, Baltimore, MD 21224, USA. sharoval@mail.nih.gov

BMC Genomics ; 9: 269, 2008 Jun 03.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-18522731

Assuntos

Algoritmos; Imunoprecipitação da Cromatina/métodos; Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo; Genoma; Proteínas HMGB/metabolismo; Proteínas de Homeodomínio/metabolismo; Fator 3 de Transcrição de Octâmero/metabolismo; Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos; Fatores de Transcrição/metabolismo; Animais; Sítios de Ligação; Proteínas de Ligação a DNA/genética; Células-Tronco Embrionárias/metabolismo; Proteínas HMGB/genética; Proteínas de Homeodomínio/genética; Humanos; Camundongos; Proteína Homeobox Nanog; Fator 3 de Transcrição de Octâmero/genética; Fatores de Transcrição SOXB1; Fatores de Tempo; Fatores de Transcrição/genética

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Algoritmos / Genoma / Proteínas de Homeodomínio / Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos / Proteínas HMGB / Imunoprecipitação da Cromatina / Proteínas de Ligação a DNA / Fator 3 de Transcrição de Octâmero Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2008 Tipo de documento: Article

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