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Evaluation of functional gene enrichment in a soil metagenomic clone library.
Demanèche, Sandrine; David, Maude M; Navarro, Elisabeth; Simonet, Pascal; Vogel, Timothy M.
Afiliação
  • Demanèche S; Environmental Microbial Genomics Group, Laboratoire AMPERE, UMR CNRS 5005, Ecole Centrale de Lyon, Université de Lyon, 36 avenue Guy de Collongue 69134 Ecully France.
J Microbiol Methods ; 76(1): 105-7, 2009 Jan.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-18922230
ABSTRACT
We evaluated the use of mixed oligonucleotide probes hybridized to metagenomic clones spotted on high density membranes. The pooled probes included oligonucleotides designed for genes associated with denitrification, antibiotic resistance, and dehalogenation among others. Pyrosequence comparison between the clones and the original DNA demonstrated the utility of clone screening with pooled probes.
Assuntos

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Microbiologia do Solo / Bactérias / Proteínas de Bactérias / Biblioteca Gênica / Genoma Bacteriano / Hibridização de Ácido Nucleico Tipo de estudo: Evaluation_studies Idioma: En Ano de publicação: 2009 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Microbiologia do Solo / Bactérias / Proteínas de Bactérias / Biblioteca Gênica / Genoma Bacteriano / Hibridização de Ácido Nucleico Tipo de estudo: Evaluation_studies Idioma: En Ano de publicação: 2009 Tipo de documento: Article