Significant speedup of database searches with HMMs by search space reduction with PSSM family models.

Beckstette, Michael; Homann, Robert; Giegerich, Robert; Kurtz, Stefan

Beckstette, Michael; Homann, Robert; Giegerich, Robert; Kurtz, Stefan.

Afiliação

Beckstette M; Center for Bioinformatics, University of Hamburg, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany. beckstette@zbh.uni-hamburg.de

Bioinformatics ; 25(24): 3251-8, 2009 Dec 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-19828575

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Bases de Dados de Proteínas; Cadeias de Markov; Matrizes de Pontuação de Posição Específica; Proteínas/classificação; Alinhamento de Sequência/métodos; Análise de Sequência de Proteína/métodos; Algoritmos; Reconhecimento Automatizado de Padrão/métodos; Software

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas / Cadeias de Markov / Alinhamento de Sequência / Biologia Computacional / Análise de Sequência de Proteína / Bases de Dados de Proteínas / Matrizes de Pontuação de Posição Específica Tipo de estudo: Health_economic_evaluation / Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2009 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google