Evaluation of data-dependent and -independent mass spectrometric workflows for sensitive quantification of proteins and phosphorylation sites.

Bauer, Manuel; Ahrné, Erik; Baron, Anna P; Glatter, Timo; Fava, Luca L; Santamaria, Anna; Nigg, Erich A; Schmidt, Alexander

Bauer, Manuel; Ahrné, Erik; Baron, Anna P; Glatter, Timo; Fava, Luca L; Santamaria, Anna; Nigg, Erich A; Schmidt, Alexander.

Afiliação

Bauer M; Biozentrum, University of Basel , Klingelbergstrasse 50/70, CH-4056 Basel, Switzerland.

J Proteome Res ; 13(12): 5973-88, 2014 Dec 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25330945

Assuntos

Cromatografia Líquida/métodos; Espectrometria de Massas/métodos; Fosfopeptídeos/análise; Espectrometria de Massas em Tandem/métodos; Sequência de Aminoácidos; Sítios de Ligação; Proteínas de Ciclo Celular/metabolismo; Extratos Celulares/análise; Células HeLa; Humanos; Dados de Sequência Molecular; Proteínas Nucleares/metabolismo; Fosfopeptídeos/metabolismo; Fosforilação; Proteômica/métodos; Reprodutibilidade dos Testes

Palavras-chave

MAD1; Targeted mass spectrometry; cell cycle; data-dependent acquisition; directed mass spectrometry; limit of detection; peptide quantification; phosphorylation

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fosfopeptídeos / Espectrometria de Massas / Cromatografia Líquida / Espectrometria de Massas em Tandem Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Evaluation_studies / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article

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