A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species.

Silva-Junior, Orzenil B; Faria, Danielle A; Grattapaglia, Dario

Silva-Junior, Orzenil B; Faria, Danielle A; Grattapaglia, Dario.

Afiliação

Silva-Junior OB; Laboratório de Bioinformática, EMBRAPA Recursos Genéticos e Biotecnologia, PqEB, 70770-970, Brasilia, DF, Brazil.
Faria DA; Programa de Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, SGAN 916, 70790-160, Brasilia, DF, Brazil.
Grattapaglia D; Laboratório de Genética Vegetal, EMBRAPA Recursos Genéticos e Biotecnologia, PqEB, 70770-970, Brasilia, DF, Brazil.

New Phytol ; 206(4): 1527-40, 2015 Jun.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25684350

Assuntos

Eucalyptus/genética; Genoma de Planta; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos; Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética; Árvores/genética; Análise por Conglomerados; Genética Populacional; Genótipo; Anotação de Sequência Molecular; Especificidade da Espécie

Palavras-chave

Myrtaceae; pooled resequencing; population structure; single-nucleotide polymorphism (SNP) ascertainment bias; trans-species SNPs

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Árvores / Genoma de Planta / Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Eucalyptus / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Idioma: En Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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