Optimally choosing PWM motif databases and sequence scanning approaches based on ChIP-seq data.

Dabrowski, Michal; Dojer, Norbert; Krystkowiak, Izabella; Kaminska, Bozena; Wilczynski, Bartek

Dabrowski, Michal; Dojer, Norbert; Krystkowiak, Izabella; Kaminska, Bozena; Wilczynski, Bartek.

Afiliação

Dabrowski M; Laboratory of Bioinformatics, Nencki Institute of Experimental Biology, Pasteura 3, Warszawa, 02-093, Poland. m.dabrowski@nencki.gov.pl.
Dojer N; Institute of Informatics, Univeristy of Warsaw, Banacha 2, Warszawa, 02-097, Poland. dojer@mimuw.edu.pl.
Krystkowiak I; Laboratory of Molecular Neurobiology, Nencki Institute of Experimental Biology, Pasteura 3, Warszawa, 02-093, Poland. i.krystkowiak@nencki.gov.pl.
Kaminska B; Laboratory of Molecular Neurobiology, Nencki Institute of Experimental Biology, Pasteura 3, Warszawa, 02-093, Poland. b.kaminska@nencki.gov.pl.
Wilczynski B; Institute of Informatics, Univeristy of Warsaw, Banacha 2, Warszawa, 02-097, Poland. bartek@mimuw.edu.pl.

BMC Bioinformatics ; 16: 140, 2015 May 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25927199

Assuntos

Imunoprecipitação da Cromatina/métodos; Biologia Computacional; Bases de Dados Factuais; Genoma Humano; Motivos de Nucleotídeos/genética; Matrizes de Pontuação de Posição Específica; Fatores de Transcrição/metabolismo; Sítios de Ligação; Humanos; Ligação Proteica; Análise de Sequência de DNA

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Genoma Humano / Bases de Dados Factuais / Biologia Computacional / Imunoprecipitação da Cromatina / Matrizes de Pontuação de Posição Específica / Motivos de Nucleotídeos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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