Comparison of Different Sample Preparation Protocols Reveals Lysis Buffer-Specific Extraction Biases in Gram-Negative Bacteria and Human Cells.

Glatter, Timo; Ahrné, Erik; Schmidt, Alexander

Glatter, Timo; Ahrné, Erik; Schmidt, Alexander.

Afiliação

Glatter T; Proteomics Core Facility, Biozentrum, University of Basel , 4056 Basel, Switzerland.
Ahrné E; Proteomics Core Facility, Biozentrum, University of Basel , 4056 Basel, Switzerland.
Schmidt A; Proteomics Core Facility, Biozentrum, University of Basel , 4056 Basel, Switzerland.

J Proteome Res ; 14(11): 4472-85, 2015 Nov 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26412744

Assuntos

Artefatos; Histonas/isolamento & purificação; Extração Líquido-Líquido/métodos; Proteoma/isolamento & purificação; Proteínas Ribossômicas/isolamento & purificação; Manejo de Espécimes/métodos; Ácido Desoxicólico/química; Desoxirribonucleases/química; Expressão Gênica; Guanidina/química; Células HEK293; Histonas/genética; Histonas/metabolismo; Humanos; Proteoma/genética; Proteoma/metabolismo; Proteômica/métodos; Proteômica/normas; Pseudomonas aeruginosa/química; Proteínas Ribossômicas/genética; Proteínas Ribossômicas/metabolismo; Especificidade da Espécie; Ureia/química

Palavras-chave

FASP; Protein extraction; absolute protein quantification; guanidine hydrochloride; histone; iBAQ; protein digestion; ribosome; sodium deoxycholate; urea

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas Ribossômicas / Manejo de Espécimes / Histonas / Artefatos / Proteoma / Extração Líquido-Líquido Tipo de estudo: Guideline Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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