COMSAT: Residue contact prediction of transmembrane proteins based on support vector machines and mixed integer linear programming.

Zhang, Huiling; Huang, Qingsheng; Bei, Zhendong; Wei, Yanjie; Floudas, Christodoulos A

Zhang, Huiling; Huang, Qingsheng; Bei, Zhendong; Wei, Yanjie; Floudas, Christodoulos A.

Afiliação

Zhang H; Centre for High Performance Computing, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, 518055, China.
Huang Q; Centre for High Performance Computing, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, 518055, China.
Bei Z; Center for Cloud Computing, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, 518055, China.
Wei Y; Centre for High Performance Computing, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, 518055, China.
Floudas CA; Department of Chemical Engineering, Texas A&M University, College Station, Texas, 77843.

Proteins ; 84(3): 332-48, 2016 Mar.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26756402

Assuntos

Simulação por Computador; Proteínas de Membrana/química; Modelos Moleculares; Programação Linear; Algoritmos; Reconhecimento Automatizado de Padrão; Matrizes de Pontuação de Posição Específica; Estrutura Secundária de Proteína; Estrutura Terciária de Proteína; Reprodutibilidade dos Testes; Alinhamento de Sequência; Análise de Sequência de Proteína; Homologia Estrutural de Proteína; Máquina de Vetores de Suporte

Palavras-chave

MILP; ab initio prediction; hybrid framework; machine learning; protein structure prediction

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Programação Linear / Simulação por Computador / Modelos Moleculares / Proteínas de Membrana Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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