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Description of Endozoicomonas arenosclerae sp. nov. using a genomic taxonomy approach.
Appolinario, Luciana R; Tschoeke, Diogo A; Rua, Cintia P J; Venas, Tainá; Campeão, Mariana E; Amaral, Gilda R S; Leomil, Luciana; de Oliveira, Louisi; Vieira, Verônica Viana; Otsuki, Koko; Swings, Jean; Thompson, Fabiano L; Thompson, Cristiane C.
Afiliação
  • Appolinario LR; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Tschoeke DA; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Rua CP; Instituto de Química de São Carlos, Universidade de São Paulo, São Carlos, SP, Brazil.
  • Venas T; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Campeão ME; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Amaral GR; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Leomil L; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • de Oliveira L; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Vieira VV; Instituto Oswaldo Cruz (IOC), FIOCRUZ, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Otsuki K; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Swings J; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
  • Thompson FL; Laboratory for Microbiology, Ghent University, Ghent, Belgium.
  • Thompson CC; Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio De Janeiro, RJ, Brazil.
Antonie Van Leeuwenhoek ; 109(3): 431-8, 2016 Mar.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26786501
ABSTRACT
The taxonomic position of strains Ab112(T) (CBAS 572(T)) and Ab227_MC (CBAS 573) was evaluated by means of genomic taxonomy. These isolates represent the dominant flora cultured from the healthy marine sponge Arenosclera brasiliensis, endemic to Rio de Janeiro. Strains CBAS 572(T) and CBAS 573 shared >98 % 16S rRNA sequence identity with Endozoicomonas numazuensis and Endozoicomonas montiporae. In silico DNA-DNA Hybridization, i.e. genome-to-genome distance (GGD), amino acid identity (AAI) and average nucleotide identity (ANI) further showed that these strains had <70 %, at maximum 71.1 and 78 % of identity, respectively, to their closest neighbours E. numazuensis and E. montiporae. The DNA G+C content of CBAS 572(T) and CBAS 573 were 47.6 and 47.7 mol%, respectively. Phenotypic and chemotaxonomic features also allowed a separation from the type strains of their phylogenetic neighbours. Useful phenotypic features for discriminating CBAS 572(T) and CBAS 573 from E. numazuensis and E. montiporae species include C8 esterase, N-acetyl-ß-glucosaminidase, citric acid, uridine and siderophore. The species Endozoicomonas arenosclerae sp. nov. is proposed to harbour the new isolates. The type strain is CBAS 572(T) (=Ab112(T)).
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Bacteriano / Gammaproteobacteria / Código de Barras de DNA Taxonômico Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Bacteriano / Gammaproteobacteria / Código de Barras de DNA Taxonômico Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article