The first de novo transcriptome of pepino (Solanum muricatum): assembly, comprehensive analysis and comparison with the closely related species S. caripense, potato and tomato.

Herraiz, Francisco J; Blanca, José; Ziarsolo, Pello; Gramazio, Pietro; Plazas, Mariola; Anderson, Gregory J; Prohens, Jaime; Vilanova, Santiago

Herraiz, Francisco J; Blanca, José; Ziarsolo, Pello; Gramazio, Pietro; Plazas, Mariola; Anderson, Gregory J; Prohens, Jaime; Vilanova, Santiago.

Afiliação

Herraiz FJ; Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana, Universitat Politècnica de València, Camino de Vera 14, 46022, Valencia, Spain.
Blanca J; Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana, Universitat Politècnica de València, Camino de Vera 14, 46022, Valencia, Spain.
Ziarsolo P; Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana, Universitat Politècnica de València, Camino de Vera 14, 46022, Valencia, Spain.
Gramazio P; Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana, Universitat Politècnica de València, Camino de Vera 14, 46022, Valencia, Spain.
Plazas M; Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana, Universitat Politècnica de València, Camino de Vera 14, 46022, Valencia, Spain.
Anderson GJ; Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Connecticut, Storrs, CT, 06268-3043, USA.
Prohens J; Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana, Universitat Politècnica de València, Camino de Vera 14, 46022, Valencia, Spain. jprohens@btc.upv.es.
Vilanova S; Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana, Universitat Politècnica de València, Camino de Vera 14, 46022, Valencia, Spain. sanvina@upvnet.upv.es.

BMC Genomics ; 17: 321, 2016 05 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27142449

Assuntos

Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Análise de Sequência de RNA/métodos; Solanum lycopersicum/genética; Solanum/classificação; Evolução Molecular; Flores/genética; Ontologia Genética; Variação Genética; Anotação de Sequência Molecular; Filogenia; Folhas de Planta/genética; Proteínas de Plantas/genética; Solanum/genética; Solanum tuberosum/genética

Palavras-chave

Candidate genes; Functional annotation; Molecular markers; Pepino; Phylogeny; Potato; S. caripense; Solanaceae; Solanum muricatum; Tomato; Transcriptome

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de RNA / Solanum lycopersicum / Perfilação da Expressão Gênica / Solanum / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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